股权变更主要由市场监督管理部门和税务部门负责管理。以下是对这两个部门在股权变更中具体职责的详细阐述：

一、市场监督管理部门

市场监督管理部门（原工商行政管理部门）在股权变更中起着核心作用，主要负责变更登记工作。具体流程如下：

1. 申请变更登记：公司股权发生变更后，应自变更决议或决定作出之日起30日内，向市场监督管理部门申请变更登记。这一步骤至关重要，因为它具有公示效力，能够确保公司股权结构的透明性，从而保障交易安全，避免潜在的交易纠纷。

2. 提交必要文件：在办理股权变更登记时，需准备一系列必要的文件，包括但不限于公司法定代表人签署并加盖公章的《公司变更登记申请书》、加盖公章的《公司股东（发起人）出资情况表》、指定代表或共同委托代理人的证明及身份证件复印件、有限责任公司提交的股东会决议、股权转让协议或股权交割证明，以及新股东的主体资格证明或自然人身份证件复印件等。

3. 换发营业执照：在提交的文件符合规定后，市场监督管理部门会进行变更登记，并换发新的营业执照，这标志着股权变更的正式完成。

二、税务部门

税务部门在股权变更过程中负责税收征管工作，其关注点主要包括税收监管和纳税事项。具体职责如下：

1. 税收监管：股权变更可能涉及印花税、个人所得税（转让方为个人时）或企业所得税（转让方为企业时）等税费。税务部门会核实交易的真实性和纳税的合规性，以确保国家税收的足额征收。

2. 纳税事项：

   • 印花税：股权转让所立的书据属于印花税征税税目，转让双方均需按规定缴纳。
   • 个人所得税：个人转让股权若产生转让所得，应按“财产转让所得”项目缴纳个人所得税。
   • 企业所得税：企业转让股权取得的收入属于企业所得税应税收入，应依法缴纳企业所得税。

3. 完税证明：在完成税务申报和缴纳相关税费后，税务部门会出具完税证明，这是办理股权变更登记的重要前置条件之一。

总结与建议

股权变更是一个涉及多个部门和多项法律法规的复杂过程。为确保变更的顺利进行，我建议企业在股权变更前充分了解相关法律法规和政策要求，准备齐全所需文件，并及时咨询当地市场监督管理部门和税务部门以获取准确的信息和指导。同时，企业应重视税收合规性，确保在股权变更过程中依法纳税，避免潜在的税务风险。

在股权变更过程中，如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。