若已起诉后需进行伤残鉴定，但后续还需二次手术，可分以下两种情况处理：

1. 伤残鉴定时机选择与二次手术的关系
   根据《人体损伤致残程度分级》规定，伤残鉴定需在“治疗终结”后进行，即临床医学一般原则所承认的临床效果稳定。若二次手术是治疗过程中必须进行的（如内固定取出术），且该手术对伤残等级可能产生影响（如影响关节活动度），则应在二次手术后重新鉴定或补充鉴定。例如：若首次鉴定时因内固定未取出导致关节活动受限，但取出后功能恢复，则原鉴定结论可能不准确，需重新评估。
   法律依据：《人体损伤致残程度分级》第4.2条明确“鉴定时机应在原发性损伤及其与之确有关联的并发症治疗终结或者临床治疗效果稳定后进行鉴定”。

2. 诉讼程序中的处理方式

   • 若二次手术在起诉后、一审判决前进行：可向法院申请延期鉴定或中止诉讼，待二次手术完成后一并处理伤残等级及后续治疗费。此时需提交医疗机构出具的“二次手术必要性证明”及预计费用清单，作为主张赔偿的依据。
     
   • 若二次手术在一审判决后、二审或执行阶段进行：可就二次手术产生的实际费用（如医疗费、误工费等）另行起诉，要求对方承担。此时需保留手术记录、费用发票等证据，并证明该费用与原侵权行为存在因果关系。
     实务建议：在起诉时，可一并主张“后续治疗费”（需医疗机构出具证明或鉴定结论），避免后续诉讼成本；若无法确定具体金额，可待实际发生后另行主张。

总结：二次手术不影响伤残鉴定的合法性，但需根据手术对伤残等级的实际影响决定是否重新鉴定。诉讼中可通过申请延期、中止或另行起诉等方式保障权益，具体需结合手术必要性、鉴定时机及证据情况综合判断。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件处理方案。