结论前置：农村一个宅基地上有三个房产和三个土地证是否合法，需分情况讨论。一般情况下，一个宅基地对应一个土地证是合法的，若存在多个土地证，则可能涉及违法或特殊情况。以下是对此问题的详细分析：
一、宅基地与土地证的基本关系
宅基地是农村村民用于建造住宅及其附属设施的集体所有土地。根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，宅基地的使用权通常以“户”为单位进行分配，且一户只能拥有一处宅基地。土地证则是证明土地使用权归属的法律文件，通常情况下，一个宅基地应对应一个土地证。
二、存在多个房产和土地证的可能情况及合法性分析
历史遗留问题：
- 在某些地区，由于历史原因或管理不善，可能存在一个宅基地上发放了多个土地证的情况。这种情况下，虽然存在多个土地证，但并不一定代表合法。若这些土地证是在不符合法律规定的情况下发放的，那么它们可能是无效的。
非法分割或转让：
- 如果宅基地被非法分割或转让，导致一个宅基地上出现了多个房产和土地证，那么这种行为是违法的。宅基地的使用权不得非法转让，且分割宅基地也需符合相关法律规定。
合法继承或赠与：
- 在某些特殊情况下，如通过合法继承或赠与，一个宅基地上的房产可能归属于多个家庭成员。然而，即使如此，土地证通常仍应保持为一个，反映宅基地的整体使用权。若因此办理了多个土地证，可能涉及土地管理部门的违规操作。
误发或重复发证：
- 由于管理疏忽或错误，土地管理部门可能误发或重复发放了土地证。这种情况下，多个土地证并不代表合法的土地使用权，需及时向土地管理部门申请更正。
三、法律建议与后果
- 核实土地证真实性：首先，应核实这三个土地证的真实性和合法性。可以通过向当地土地管理部门查询或申请信息公开来获取相关信息。
- 咨询专业意见：如果怀疑土地证的合法性或存在争议，建议咨询专业律师或土地管理部门，以获取更准确的法律意见。
- 可能的法律后果：若存在多个非法土地证，可能面临土地使用权被收回、罚款或其他法律责任。同时，非法分割或转让宅基地也可能导致相关合同无效或面临其他法律纠纷。
四、特殊情况说明
- 在某些地区或特定情况下，可能存在政策上的特殊规定或例外情况。然而，这些特殊情况通常需符合严格的法律条件和程序，且并不改变“一户一宅”的基本原则。
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