针对持有营业执照的殡葬用品店在拆迁中的补偿问题，核心结论如下：

1. 补偿范围需覆盖经营性损失
   根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条及地方实施细则，拆迁补偿不仅包括房屋、土地价值补偿，还需对因拆迁导致的停产停业损失、设备搬迁费用、员工安置费用等经营性损失进行补偿。殡葬用品店作为合法经营主体，其补偿需体现经营特性（如库存商品损耗、客户流失等间接损失）。

2. 营业执照是认定合法经营的关键依据
   若店铺持有有效营业执照且实际经营地址与注册地址一致，可主张“合法经营主体”身份，要求按实际经营年限、纳税记录、员工数量等参数计算停产停业损失。部分地区（如《北京市国有土地上房屋征收停产停业损失补偿暂行办法》）明确规定，补偿标准可按被征收房屋价值的5%-10%或按实际经营面积每平方米补偿一定金额（如500-1000元/㎡）执行。

3. 特殊行业补偿需关注地方性规定
   殡葬用品店属于特殊行业，部分城市可能出台专项补偿政策。例如，若店铺位于政府规划的殡葬服务集中区域，可能涉及搬迁补贴或优先安置权；若因拆迁导致经营资质失效（如殡葬服务许可证需重新申办），可主张资质恢复成本补偿。需重点核查地方《殡葬管理条例》及拆迁补偿方案是否包含此类条款。

4. 补偿协商与证据固定要点

   • 证据清单：营业执照、纳税证明、租赁合同（若为承租人）、库存清单、员工劳动合同、近三年财务报表、客户订单记录等。
     
   • 协商策略：若拆迁方未主动提及经营性损失补偿，可依据《行政诉讼法》第十二条提起行政复议或诉讼，要求重新评估补偿方案。
     
   • 注意时效：停产停业损失补偿通常需在拆迁公告发布后一定期限内（如6个月）提出主张，逾期可能视为放弃权利。

建议行动步骤：

1. 立即向拆迁方索要书面补偿方案，核对是否包含经营性损失条款；
   
2. 委托评估机构对店铺停产停业损失进行专项评估（需选择具有司法鉴定资质的机构）；
   
3. 若协商无果，可在收到补偿决定之日起60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼。
   

如有具体补偿方案或地方政策疑问，可进一步提供细节，我将结合案例与法条为您深度解析。