针对“没有实际交付的欠款协议受时效限制吗”的问题：
欠款协议与实际交付的关系：
- 欠款协议本身是一个合同，它规定了双方的权利和义务，包括借款金额、还款期限等。然而，一个有效的借款合同不仅需要双方的意思表示一致，还需要借款的实际交付。若没有实际交付，则借款合同可能因缺乏实际履行而未生效或存在效力瑕疵。
时效限制的适用：
- 时效限制，通常指的是诉讼时效，即权利人在法定期间内不行使权利，即丧失请求法院依法保护其民事权利的权利。对于已经生效且实际履行的借款合同，诉讼时效通常从还款期限届满之日起计算。
- 若欠款协议未实际交付，则可能因合同未生效或存在效力瑕疵而影响诉讼时效的起算。但严格来说，诉讼时效的起算需基于一个有效且可执行的债权。若协议未实际交付，可能意味着债权并未真正成立，此时讨论诉讼时效可能缺乏前提。不过，若后续有证据表明借款已实际发生（如通过其他方式交付），则应从实际交付或应交付之日起计算诉讼时效。
法律建议：
- 对于未实际交付的欠款协议，建议双方先协商解决，明确借款是否已发生及具体金额。若协商无果，且一方认为存在债权，应及时咨询专业律师，评估诉讼时效及其他法律风险。
针对“出借人扣借款人工程款合法吗”的问题：
扣款行为的合法性分析：
- 出借人扣借款人工程款的行为，其合法性取决于多个因素，包括但不限于：双方之间的合同约定、扣款的原因是否合理、扣款程序是否合法等。
- 若合同中有明确约定：如借款人同意在特定条件下（如逾期还款）出借人有权扣款，则出借人的扣款行为可能具有合法性。但需注意，该约定不得违反法律、行政法规的强制性规定，且不得损害国家、集体或第三人的利益。
- 若合同中无明确约定：则出借人擅自扣款可能构成违约或侵权，借款人有权要求出借人返还被扣款项，并可能要求出借人承担违约责任或赔偿责任。
可能的法律后果：
- 若出借人的扣款行为被认定为违法，借款人可以通过法律途径维护自己的权益，如向法院提起诉讼，要求出借人返还被扣款项及赔偿损失。
- 同时，出借人也可能因违法扣款行为而面临行政处罚或刑事责任（如构成侵占罪等）。
法律建议：
- 对于出借人而言，在扣款前应仔细审查合同条款，确保扣款行为有合法依据。若合同中无明确约定，应与借款人协商解决，避免擅自扣款。
- 对于借款人而言，若认为出借人的扣款行为违法，应及时收集证据，咨询专业律师，通过法律途径维护自己的权益。
总结与建议：
- 对于没有实际交付的欠款协议，其诉讼时效的起算可能受到影响，建议双方先协商解决或咨询专业律师。
- 对于出借人扣借款人工程款的行为，其合法性取决于合同约定及扣款程序的合法性。若认为违法，借款人应及时维护自己的权益。
- 在处理此类纠纷时，建议双方保持冷静，通过合法途径解决争议，避免采取过激行为导致法律后果的扩大。有问题可以直接向我咨询，我会提供专业的法律意见。