手写协议只有一方持有，并不直接决定其法律效力，协议的有效性取决于多个因素。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、协议有效性的基本条件
内容合法合规：
- 协议内容必须严格遵守法律法规的强制性规定，不得涉及任何违法活动或违背公序良俗的内容。例如，关于合法的商品买卖、服务提供等约定，只要条款合理且符合法律要求，即构成有效的协议内容。
双方自愿签订：
- 尽管只有一方持有协议，但协议的签订必须是基于双方的真实意愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等不正当手段。这确保了协议是双方平等协商、自愿达成的结果。若存在欺诈或胁迫情形，受影响方有权请求撤销协议。
具备民事行为能力：
- 签订协议的双方当事人都必须具有相应的民事行为能力。对于成年人而言，除非存在精神异常等情况，否则一般均视为具备行为能力。若一方为无民事行为能力人（如不满8周岁的未成年人、不能辨认自己行为的成年人等），其独立实施的民事法律行为将被视为无效。
形式符合要求：
- 手写协议作为书面形式的一种，在法律上是被认可的。但关键在于，协议上必须有双方的签名或印章，以证明双方对协议内容的认可和接受。即使只有一方持有协议，只要协议上有双方的签名或印章，且满足其他生效条件，该协议仍然有效。
二、仅一方持有协议可能带来的问题
证明协议存在的困难：
- 如果只有一方持有协议，另一方可能否认协议的存在或内容。在这种情况下，持有协议的一方需要提供其他证据来证明协议的真实性和内容，如聊天记录、邮件往来、证人证言等。
协议修改和履行的争议：
- 如果协议在履行过程中需要进行修改，而只有一方持有原始协议，那么修改后的协议内容可能难以得到另一方的认可。此外，在协议履行过程中，如果发生争议，持有协议的一方可能因无法提供完整的协议文本而处于不利地位。
三、建议与措施
确保双方各执一份：
- 为了避免上述问题，建议在签订手写协议时，确保双方各执一份协议文本。这样，在协议履行过程中或发生争议时，双方都能提供完整的协议文本作为证据。
完善协议形式：
- 除了双方的签名或印章外，还可以考虑在协议上注明签订日期、地点等详细信息，以增加协议的真实性和可信度。此外，对于重要的协议条款，可以要求双方在协议上按手印或加盖公章以进一步确认。
寻求法律帮助：
- 如果对协议的法律效力或履行过程存在疑虑，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见和帮助，确保协议的合法性和有效性。
总结来看，手写协议只有一方持有并不直接决定其法律效力。协议的有效性取决于内容合法合规、双方自愿签订、具备民事行为能力以及形式符合要求等多个因素。为了避免潜在的风险和争议，建议确保双方各执一份协议文本，并完善协议形式。如有任何疑虑或问题，请随时向我咨询。