同居期间共同经营的公司分割需根据出资比例、贡献程度、协议约定及实际经营情况综合判定，具体处理方式如下：

1. 优先依据书面协议分割

若双方在同居期间或公司设立时签订了书面协议（如合作协议、股东协议），明确约定了股权分配、利润分配、退出机制等内容，则应优先按协议约定处理。
关键点：协议需合法有效（无欺诈、胁迫、显失公平等情形），且内容具体明确（如股权比例、分红规则、决策权分配等）。若协议存在争议，需通过司法鉴定或证据链补强证明其真实性。

2. 无协议时按出资比例分割

若未签订书面协议，但能证明双方对公司的出资情况（如银行转账记录、出资证明书、验资报告等），则通常按实际出资比例分割股权或财产权益。
例外情形：

• 若一方以劳务、技术、知识产权等非货币形式出资，需评估其价值并折算为出资比例（需专业机构评估）；
  
• 若一方存在隐名出资（实际出资但未登记为股东），需通过代持协议、其他股东认可等证据证明其权益。

3. 按贡献程度调整分割比例

即使出资比例相同，若一方在经营中承担了主要管理职责、技术投入或客户资源引入等核心贡献，法院可能酌情调整分割比例。
法律依据：根据《民法典》第1087条，分割共同财产时需考虑“照顾子女、女方和无过错方权益”原则，但公司分割更侧重“实际贡献”与“公平性”。
证据要求：需提供经营记录、会议纪要、客户证言等证明贡献程度的材料。

4. 公司性质影响分割方式

• 有限责任公司：股权转让需其他股东过半数同意，且优先购买权可能限制外部转让。若双方均想保留股权，可协商内部转让；若均想退出，需寻找第三方受让或解散清算。
  
• 股份有限公司：股权流动性较强，可通过证券市场转让，但需遵守《公司法》及章程关于信息披露、限售期的规定。
  
• 个体工商户/个人独资企业：若公司以个人名义登记，但实际为双方共同经营，可能被认定为“共同财产”，需按出资或贡献分割资产。

5. 解散清算作为最后手段

若双方无法就分割达成一致，且公司持续经营会导致矛盾激化，可主张解散公司并进行清算。
流程：召开股东会形成解散决议→成立清算组→通知债权人申报债权→清理资产、清偿债务→分配剩余财产。
风险提示：解散可能导致公司价值贬损（如客户流失、品牌价值下降），需谨慎评估。

6. 特殊情形处理

• 一方存在过错：如挪用资金、虚假出资、与他人同居导致关系破裂等，可能被认定存在过错，分割时少分或不分。
  
• 子女抚养关联：若双方有未成年子女，法院可能考虑子女生活需求，在分割时倾斜保障子女利益（如保留股权由一方代持，收益用于子女抚养）。

建议行动步骤：

1. 收集出资证明、经营记录、协议文本等证据；
   
2. 协商确定分割方案（可引入第三方调解）；
   
3. 若协商不成，委托律师起诉至法院，申请财产保全（防止公司资产转移）；
   
4. 参与庭审，提交证据并主张权益。
   

如有具体案件细节（如出资额、协议内容、经营贡献等），可进一步向我提供，我将结合证据制定更精准的分割方案。