结论：加班制度本身并不违法，但其合法性取决于是否遵循法定程序、是否保障劳动者权益以及是否符合特殊情形下的加班规定。结合南航安全员猝死事件，用人单位需严格遵守加班制度，避免因违法安排加班而承担法律责任。
一、加班制度的合法性基础
协商一致原则
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要延长工作时间的，必须与工会和劳动者协商一致。这意味着，未经协商的单方面强制加班是违法的。
- 加班时间也受到严格限制：一般每日不得超过一小时；特殊原因下，每日不得超过三小时，每月累计不得超过三十六小时。
劳动者拒绝权
- 《劳动法》第三十八条明确规定，用人单位应保证劳动者每周至少休息一日。对于违反法律、法规强迫劳动者延长工作时间的，劳动者有权拒绝。
- 在南航安全员猝死事件中，若用人单位未经协商强制安排高强度体能测试（可视为一种特殊形式的“加班”），则可能涉嫌违法。
二、特殊情形下的加班规定
尽管一般情况下加班需协商一致，但在某些特殊情形下，用人单位可以不受上述时间限制的约束来安排加班，这些情形包括：
- 发生自然灾害、事故等紧急状况，威胁劳动者生命健康和财产安全，需要紧急处理；
- 生产设备、交通运输线路、公共设施发生故障，影响生产和公众利益，必须及时抢修；
- 必须利用法定节假日或公休日进行设备检修保养；
- 完成国防紧急任务或其他紧急生产任务；
- 法律、行政法规规定的其他情形。
但即便在这些特殊情形下，用人单位也应：
- 支付加班费（按照《劳动法》第四十四条的标准）；
- 确保加班时间不超过法定限制（如每月累计不超过三十六小时，特殊情况需报劳动部门批准）；
- 保障劳动者的身体健康和生命安全。
三、南航安全员猝死事件的法律分析
事件概述
- 南航安全员在参加3公里跑步体能测试时突发疾病，经抢救无效离世。
- 该事件引发了对用人单位安排高强度活动（可视为特殊加班）的合法性的关注。
法律定性
- 若用人单位未经协商强制安排高强度体能测试，且未提供必要的健康检查和安全保障措施，则可能涉嫌违反《劳动法》关于加班和劳动者健康保护的规定。
- 用人单位需承担因违法安排加班而导致的法律责任，包括但不限于赔偿损失、支付加班费等。
对公众的启示
- 用人单位应严格遵守加班制度，避免因违法安排加班而承担法律责任。
- 劳动者应了解自己的权利，勇于拒绝非法强制加班，并在必要时通过法律途径维护自身权益。
四、加班费的支付标准
根据《劳动法》第四十四条的规定，用人单位安排劳动者加班的，应按照以下标准支付加班费：
- 延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
- 休息日安排工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
- 法定休假日安排工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
若用人单位未支付加班费，劳动者可以通过以下途径维护自身权益：
- 向劳动监察部门投诉；
- 申请劳动争议仲裁；
- 向人民法院提起诉讼。
五、劳动者应对违法加班的措施
面对用人单位违法安排加班的情况，劳动者可以采取以下措施维护自身权益：
- 沟通协商：首先与用人单位进行沟通，明确表达拒绝违法加班的立场，并指出这种行为的违法性。
- 投诉举报：向劳动监察部门投诉，劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行查处。
- 申请仲裁或诉讼：若沟通无果，可以向劳动争议仲裁机构申请仲裁，要求用人单位支付加班工资、纠正违法加班行为等。对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
总结：加班制度本身并不违法，但其合法性取决于是否遵循法定程序、是否保障劳动者权益以及是否符合特殊情形下的加班规定。用人单位应严格遵守相关法律法规，尊重劳动者的休息权和健康权。劳动者也应了解自己的权利，勇于维护自身权益。在面对违法加班时，应及时通过法律途径解决问题。