父亲有案底，儿子一般能开出无罪证明，但需视具体情况而定，且该证明与父亲案底无直接关联。以下从不同角度进行详细分析：

一、无罪证明的性质与开具条件

无罪证明，通常指的是由公安机关或其他相关部门出具的，证明某人在特定时间段内没有犯罪记录的证明文件。其开具主要基于个人的犯罪记录情况，而非其家庭成员的犯罪记录。

1. 个人犯罪记录：无罪证明的核心是证明个人没有犯罪记录。因此，只要儿子本人没有犯罪记录，理论上就可以开具无罪证明。
2. 家庭成员犯罪记录：父亲有案底，这属于家庭成员的犯罪记录，并不直接影响儿子无罪证明的开具。因为无罪证明是针对个人而言的，与家庭成员的犯罪记录无直接关联。

二、可能影响无罪证明开具的特殊情况

尽管父亲有案底一般不影响儿子开具无罪证明，但在某些特殊情况下，可能会间接影响：

1. 特定职业或岗位的政审：如果儿子想要从事某些特定职业或岗位，如公务员、警察、军人等，这些职业或岗位在招聘或录用时可能会进行政审。政审过程中，除了审查儿子本人的犯罪记录外，还可能会审查其家庭成员的犯罪记录。如果父亲有严重犯罪记录，可能会对儿子的政审结果产生一定影响。但这种影响并非直接导致无法开具无罪证明，而是可能影响儿子从事某些特定职业或岗位的资格。
2. 出国移民或签证申请：在出国移民或签证申请过程中，有些国家或地区可能会要求申请人提供无犯罪记录证明，并可能对申请人的家庭成员犯罪记录进行审查。如果父亲有严重犯罪记录，可能会对儿子的移民或签证申请产生一定影响。但同样，这种影响并非直接导致无法开具无罪证明。

三、法律建议与后续行动

1. 了解具体要求：如果儿子需要开具无罪证明，建议先了解开具单位或机构的具体要求。不同单位或机构可能对无罪证明的开具条件和程序有所不同。
2. 准备相关材料：根据开具单位或机构的要求，准备相关材料，如身份证、户口本等。这些材料是开具无罪证明的基本依据。
3. 咨询相关部门：如果对开具无罪证明的程序或要求有疑问，可以咨询当地公安机关或其他相关部门。他们会提供详细的指导和帮助。
4. 关注政审或审查结果：如果儿子想要从事特定职业或岗位，或进行出国移民或签证申请，需要关注政审或审查结果。如果因为父亲有案底而受到影响，可以咨询专业律师，了解相关法律规定和应对策略。

总结来说，父亲有案底一般不影响儿子开具无罪证明。但儿子在从事特定职业或岗位、出国移民或签证申请等过程中，可能会因为父亲有案底而受到间接影响。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。