若对方公司以项目专用付款账户打款，需分情况处理，核心结论如下：

1. 若该打款行为符合合同约定
   若双方合同中明确约定了“项目专用账户”作为收款账户（例如约定“甲方应将款项支付至乙方以下项目专用账户：XXX”），则对方行为属于正常履约。此时需注意：

   • 核对账户信息：确认打款账户与合同约定完全一致（包括开户行、账号、账户名称），避免因信息误差导致款项被退回或产生纠纷。
     
   • 留存凭证：及时保存银行流水、转账回单等证据，证明对方已按约定履行付款义务，避免后续对方主张“未付款”或“付款错误”。
     
   • 项目资金管理：若该账户为专款专用（如用于特定项目采购、施工等），需确保资金用途符合合同或监管要求，避免挪用引发违约或行政责任。

2. 若合同未约定项目专用账户，但对方单方使用该账户打款
   若合同未明确收款账户，或仅约定“乙方指定账户”但未限定为“项目专用账户”，对方单方使用项目专用账户打款可能涉及以下风险：

   • 付款效力风险：若该账户因冻结、注销等原因无法正常收款，或对方后续主张“已付款但乙方未收到”，可能引发付款纠纷。此时需立即联系对方确认付款状态，并要求重新支付至可正常使用的账户。
     
   • 资金混同风险：若项目专用账户同时用于其他项目或个人用途，可能被认定为“资金混同”，导致对方主张你方违反财务规范（如建设工程领域中，承包人将工程款与自有资金混同可能面临发包人索赔）。
     
   • 应对建议：
     
     • 书面确认：向对方发送《收款账户确认函》，明确“我方同意接收贵方通过项目专用账户（XXX）支付的款项，但该账户仅作为本次交易收款使用，不视为我方对账户性质的认可”；
       
     • 另开账户：若项目周期较长或资金规模较大，可要求对方将款项支付至你方新开的专用账户，并明确账户用途（如“仅用于XX项目款项收支”）。

3. 若对方以项目专用账户打款但涉嫌违法（如洗钱、逃税）
   若对方要求你方配合提供虚假合同、发票，或通过项目专用账户转移资金以逃避监管，可能涉及刑事犯罪风险（如洗钱罪、虚开发票罪）。此时需：

   • 立即拒绝：明确告知对方“我方严格遵守法律法规，不参与任何违法资金流转行为”；
     
   • 留存证据：保存对方要求违法操作的聊天记录、邮件、录音等证据；
     
   • 报告监管：若对方持续施压，可向公安机关、税务机关或行业主管部门举报，避免自身陷入法律风险。

总结：对方使用项目专用账户打款是否合法，需结合合同约定、账户性质及资金用途综合判断。若存在疑问或风险，建议直接联系我进一步分析，我会根据具体交易背景、合同条款及行业规范，为你提供针对性的法律方案。