若当事人刑事申诉调取卷宗法院不允许，可按以下步骤处理：

1. 明确法院拒绝调取的法律依据与理由
   根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，当事人及其辩护人、诉讼代理人有权申请调取案卷材料，但需符合法定条件（如证明案件事实需要、涉及关键证据等）。若法院拒绝，通常会出具书面裁定或口头说明理由，常见理由包括：

   • 申请材料不符合形式要求（如未提交身份证明、授权委托书等）；
     
   • 申请调取的内容不属于法定可调取范围（如涉及国家秘密、个人隐私且未获许可）；
     
   • 案件已进入特定程序（如二审、再审期间，卷宗已移交上级法院）。
     建议：要求法院出具书面拒绝裁定，明确拒绝理由，以便针对性应对。

2. 区分不同程序阶段，采取对应救济措施

   • 一审阶段：若法院拒绝调取，可向法院提交书面复议申请，要求重新审查调取申请的合法性；若仍被拒绝，可向上级法院申诉，请求监督下级法院的违法行为。
     
   • 二审/再审阶段：若卷宗已移交上级法院，可向上级法院申请调取；若上级法院拒绝，可依据《刑事诉讼法》第253条，以“违反法定诉讼程序”为由申请再审。
     
   • 执行阶段：若涉及执行问题，可向执行法院申请调取执行卷宗，若被拒绝，可向上一级法院执行部门申诉。
     

3. 通过律师协助调取，突破程序限制
   根据《律师法》第35条，辩护律师有权自行调查取证，也可申请人民检察院、人民法院收集、调取证据。若法院拒绝当事人直接调取，可委托律师提交调取申请，律师可凭借执业证书和委托手续，更专业地与法院沟通，提高调取成功率。
   注意：律师调取仍需符合法定条件，若涉及国家秘密、商业秘密或个人隐私，需经法院许可。

4. 申请检察院法律监督，形成外部压力
   若法院无正当理由拒绝调取卷宗，可向同级人民检察院申请法律监督。根据《刑事诉讼法》第8条，检察院有权对刑事诉讼活动进行法律监督，包括监督法院的审判行为。检察院审查后，若认为法院拒绝调取违法，可向法院发出《纠正违法通知书》，督促法院纠正。

总结：法院拒绝调取卷宗时，首先需明确拒绝理由，再根据案件阶段选择复议、申诉、律师协助或检察院监督等途径。若涉及复杂程序或关键证据，建议及时委托律师介入，以专业手段维护合法权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。