因在沟通协调过程中未按期提交履约保函而申请支付违约金，首先需要明确合同中关于履约保函提交时间及违约金的具体约定，并依据合同条款向对方提出违约金支付请求。以下是详细分析：

一. 明确合同条款

1. 履约保函的提交时间：检查合同中是否明确规定了履约保函的提交时间。这是判断是否违约的关键依据。
2. 违约金的计算与支付：合同中应包含关于未按期提交履约保函时违约金的计算方式、支付期限及支付方式等条款。

二. 申请支付违约金

1. 向对方发送书面通知：在确认自身违约后，应及时向对方发送书面通知，明确说明违约情况，并依据合同条款提出违约金支付请求。
2. 提供违约证据：为支持违约金支付请求，应提供相关证据，如合同复印件、履约保函提交时间记录等，以证明违约事实及违约金的计算依据。
3. 协商支付事宜：在对方收到通知后，双方可协商具体的支付时间、方式等事宜。若协商不成，可依据合同条款通过法律途径解决争议。

三. 法律依据

• 根据《中华人民共和国合同法》的相关规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。如一方不履行合同义务或履行合同义务不符合约定，应承担违约责任。
• 同时，合同法允许当事人在合同中约定违约金，以督促合同双方按约履行。因此，在合同中明确约定违约金条款的情况下，守约方有权依据合同条款要求违约方支付违约金。

我建议，在申请支付违约金时，务必保持沟通顺畅，尽量通过协商解决问题。同时，确保所提供的证据真实、有效，以维护自身合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。