劳动者与分公司签订合同，在一定条件下是可以仲裁总公司的。具体分析如下：
分公司具备独立用工权及营业执照的情况
法律地位：根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第四条，如果分公司依法取得了营业执照或者登记证书，那么它就被视为具备了用人单位的资格。这意味着分公司可以独立地与劳动者签订劳动合同，并承担由此产生的劳动法律责任。
仲裁主体：当劳动者与这类分公司发生劳动争议时，分公司可以作为独立的仲裁主体参与劳动仲裁程序。然而，这并不意味着总公司完全脱离了责任范围。如果分公司的财产不足以承担全部责任，总公司仍然需要对分公司的债务承担补充清偿责任。
仲裁总公司的情况：虽然分公司可以独立参与仲裁，但在某些情况下，劳动者可能选择直接仲裁总公司。例如，当劳动者认为总公司对分公司的管理或决策负有直接责任时，或者当分公司无法独立承担责任时，劳动者可以将总公司列为共同被申请人或单独仲裁总公司。
分公司未取得营业执照或登记证书的情况
法律地位：对于未依法取得营业执照或登记证书的分公司，它们通常被视为总公司的办事机构，不具备独立的用工权。这意味着它们不能独立地与劳动者签订劳动合同，也不能独立地承担劳动法律责任。
仲裁主体：当劳动者与这类分公司发生劳动争议时，劳动者应当向总公司所在地的劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请。因为分公司没有独立的法律地位，所以无法作为独立的仲裁主体参与劳动仲裁程序。
总公司责任：在这种情况下，总公司需要承担全部的劳动法律责任。如果劳动者胜诉，总公司需要履行仲裁裁决所确定的义务。
实践中的注意事项
了解分公司情况：劳动者在签订劳动合同时，应了解分公司的具体情况，包括是否取得营业执照等。这有助于劳动者在发生劳动争议时，确定正确的仲裁主体和维权策略。
保留证据：无论仲裁分公司还是总公司，劳动者都需要保留好与劳动争议相关的证据，如劳动合同、工资单、工作证等。这些证据将有助于劳动者在仲裁过程中证明自己的权益。
咨询专业律师：虽然我在这里提供了一些基本的法律指导，但每个劳动争议案件都有其独特性。因此，劳动者在遇到具体问题时，最好咨询专业的律师以获取更具体的法律建议。
综上所述，劳动者与分公司签订合同后，在一定条件下是可以仲裁总公司的。这主要取决于分公司是否具备独立的用工权以及是否依法取得了营业执照或登记证书。劳动者在遇到劳动争议时，应根据具体情况选择合适的仲裁主体和维权策略。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。