结论：校内侵占他人自行车是否会留案底，取决于侵占行为的性质、情节严重程度以及是否受到刑事处罚。若行为构成犯罪并被判处刑罚，则会留有案底；若不构成犯罪或仅受到行政处罚，则不会留有刑事案底。
分析说明：
侵占行为的性质：
- 侵占他人自行车，首先可能涉及的是民事侵权问题，即侵犯了他人的财产权。在这种情况下，侵占者可能需要承担民事赔偿责任，如返还自行车或赔偿损失等。
- 若侵占行为情节严重，如多次侵占、侵占数额较大或采用暴力、威胁等手段，则可能构成犯罪，如盗窃罪或侵占罪（具体取决于侵占的方式和情节）。
刑事处罚与案底：
- 如果侵占行为构成犯罪，并被法院判处刑罚（如有期徒刑、拘役、罚金等），那么侵占者将留有刑事案底。案底是指个人因犯罪行为而留下的记录，它会对个人的信用、就业、出国等方面产生负面影响。
- 相反，如果侵占行为不构成犯罪，或者虽然构成犯罪但情节轻微，仅受到行政处罚（如警告、罚款、拘留等），则不会留有刑事案底。行政处罚是行政机关对违反行政法规的行为所给予的制裁，它不会留下刑事犯罪的记录。
校内侵占的特殊性：
- 校内侵占他人自行车，虽然发生在校园内，但并不影响其法律性质的判断。无论是校内还是校外，侵占他人财产的行为都可能受到法律的制裁。
- 然而，由于校园环境的特殊性，学校可能会根据校规校纪对侵占者进行内部处理，如警告、记过、开除等。这些内部处理措施与法律制裁是分开的，不会直接决定是否留有案底。
法律建议：
- 如果您或他人遭遇了校内侵占自行车的情况，建议首先尝试与侵占者协商解决，要求其返还自行车或赔偿损失。
- 如果协商无果，可以向学校保卫部门或相关部门报告，寻求学校的帮助和支持。
- 如果侵占行为情节严重，涉嫌犯罪，建议及时向公安机关报案，并配合调查工作。
- 在任何情况下，都应保留好相关证据（如自行车购买凭证、侵占现场的照片或视频等），以便在需要时提供证明。
后续行动与思考依据：
- 如果侵占行为被认定为犯罪并受到刑事处罚，侵占者将面临长期的法律后果，包括案底记录对个人生活的影响。因此，应尽量避免触犯法律，尊重他人的财产权。
- 对于学校而言，应加强校园安全管理，完善校规校纪，对侵占等违法行为进行及时有效的处理，以维护校园秩序和学生的合法权益。
- 对于个人而言，应提高法律意识，了解自己的权利和义务，遇到问题时及时寻求法律帮助和支持。