工资不是从对公账户发放，申请劳动仲裁时一般不会有直接影响，但可能间接影响劳动关系的认定和工资数额的证明。以下从不同角度为您详细分析：

1. 对劳动关系认定的影响

• 核心原则：劳动关系的认定主要依据《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号），核心要素包括用人单位与劳动者是否符合法律、法规规定的主体资格，用人单位依法制定的各项劳动规章制度是否适用于劳动者，劳动者是否受用人单位的劳动管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动，以及劳动者提供的劳动是否是用人单位业务的组成部分。
• 工资发放形式的影响：工资是否从对公账户发放，并非认定劳动关系的唯一或决定性因素。即使工资通过个人账户或现金发放，只要存在实际用工关系，且符合上述认定标准，仍可认定劳动关系。但需注意，若用人单位未通过正规渠道发放工资，可能增加劳动者证明劳动关系的难度，需结合其他证据（如工作证、考勤记录、同事证言等）综合认定。

2. 对工资数额证明的影响

• 证据效力：在劳动仲裁中，工资数额的证明通常依赖工资条、银行流水等书面证据。若工资未通过对公账户发放，劳动者可能难以直接获取银行流水作为证据，需通过其他方式（如用人单位出具的工资证明、微信/支付宝转账记录、现金签收单等）证明工资数额。
• 举证责任：根据《劳动争议调解仲裁法》第六条，发生劳动争议，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。若劳动者无法提供充分证据证明工资数额，可能承担不利后果。因此，建议劳动者在工资发放时，要求用人单位出具书面工资证明或保留转账记录等证据。

3. 对仲裁结果的可能影响

• 合法性审查：劳动仲裁机构在审理案件时，会审查用人单位是否依法支付工资。若用人单位未通过对公账户发放工资，但已足额支付且劳动者无异议，一般不影响仲裁结果。但若用人单位存在拖欠工资、未依法缴纳社保等违法行为，即使工资未通过对公账户发放，劳动者仍有权要求用人单位承担法律责任。
• 特殊情形：若用人单位未通过对公账户发放工资，且存在逃避税务、社保等监管的嫌疑，可能引发劳动仲裁机构对用人单位合法性的进一步审查，甚至涉及行政处罚或刑事责任。但此类情形较为罕见，且与劳动者申请劳动仲裁的直接诉求关联性较弱。

4. 法律建议

• 保留证据：无论工资是否通过对公账户发放，劳动者均应保留与工资相关的所有证据，包括工资条、转账记录、现金签收单、用人单位出具的工资证明等。
• 及时维权：若用人单位存在拖欠工资、未依法缴纳社保等违法行为，劳动者应及时向劳动仲裁机构申请仲裁，维护自身合法权益。
• 咨询专业律师：在劳动仲裁过程中，若涉及复杂法律问题或证据收集困难，建议咨询专业律师，以获取更全面的法律支持和指导。

总结：工资不是从对公账户发放，不会直接影响劳动仲裁的申请和结果，但可能间接影响劳动关系的认定和工资数额的证明。劳动者在申请劳动仲裁时，应充分准备证据，确保自身权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步帮助，请直接向我咨询。