企业更换自然人（通常指的是更换法定代表人或经营者）的办理流程，主要取决于企业的类型，是有限责任公司还是个体工商户，因为这两种类型的企业在更换自然人时的手续和要求有所不同。以下我将分别就这两种情况为您详细解答。

一、有限责任公司更换法定代表人

对于有限责任公司，更换法定代表人需要提交以下材料并遵循相应手续：

1. 提交《公司变更(改制)登记申请书(公司备案申请书)》：这是变更登记的基础申请文件。

2. 提交原任法定代表人的免职证明和新任法定代表人的任职证明：

   • 免职证明通常由股东会决议、股东决定（由股东签署）或董事会决议（由公司董事签字）产生，应符合公司章程规定的表决比例。
   • 任职证明同样需要由相应的股东会、股东决定或董事会决议产生，并明确新任法定代表人的身份和职责。

3. 提交批复或许可文件（如适用）：如果法律、行政法规和国务院决定规定公司变更事项必须报经批准，那么需要提交有关的批准文件或者许可证件复印件。

4. 提交营业执照正、副本：这是进行变更登记的必要证件。

完成上述材料的准备后，您可以前往当地的企业登记机关（如市场监督管理局）进行变更登记申请。部分地区也提供了在线申请服务，如北京市的企业可以登录“企业登记e窗通服务平台”进行在线办理。

二、个体工商户更换经营者

对于个体工商户，更换经营者的办理方式有两种：

1. 直接申请变更经营者登记：

   • 根据《市场监管总局办公厅关于做好个体工商户经营者变更登记工作的通知》规定，申请人可以向登记机关申请办理经营者变更登记。
   • 在申请前，应当结清依法应缴纳的税款，并可能需要提交《清税证明》或相关税务事项结清情况的信息。
   • 申请时需要携带变更双方经营者的身份证件复印件、经办人身份证件复印件（如已实名采集则无需提供），以及未两证整合个体工商户的原《税务登记证》正本、副本（或《临时税务登记》正本、副本）进行缴销。

2. 通过“先注销、再设立”的方式实现经营者变更：

   • 如果选择这种方式，需要先注销原个体工商户，然后再以新经营者的名义设立一个新的个体工商户。
   • 在注销过程中，同样需要结清所有税款和办理相关税务注销手续。

无论选择哪种方式，个体工商户在更换经营者后，都需要及时将相关登记注册信息推送至税务部门，并处理与税务相关的后续事项，如签订新的银税三方（委托）划缴税款协议等。

总结与建议

• 有限责任公司：更换法定代表人主要涉及公司内部决议、批准文件（如适用）和营业执照的变更登记。
• 个体工商户：更换经营者可以选择直接变更登记或“先注销、再设立”的方式，并需特别注意税务事项的结清和后续处理。

在办理过程中，建议您提前咨询当地的企业登记机关或税务部门，了解具体的办理流程和所需材料，以确保变更手续的顺利进行。同时，也请注意保留好所有相关的文件和凭证，以备不时之需。