违法分包行为主要由建设行政主管部门及相关监管部门依据法律法规进行处罚。具体来说，不同领域的违法分包行为由相应的主管部门负责处理，以下是对此问题的详细解析：
一、主要监管部门及职责
住房和城乡建设主管部门
- 监管范围：作为工程建设活动的主要监督管理部门，住房和城乡建设主管部门对各类房屋建筑和市政基础设施工程中的违法分包行为具有全面的监管职责。
- 处罚措施：依据《建设工程质量管理条例》第六十二条，对于承包单位将承包的工程违法分包的行为，该部门可责令改正，没收违法所得，并处以工程合同价款百分之零点五以上百分之一以下的罚款；情节严重时，还可责令停业整顿，降低资质等级，甚至吊销资质证书。
交通运输主管部门
- 监管范围：负责公路、水运等交通建设工程中的违法分包行为监管。在公路桥梁、港口码头等项目中，若出现违法分包，交通运输主管部门将介入调查处理。
- 处罚依据：根据《公路建设市场管理办法》，违法分包行为将面临10万元以上50万元以下的罚款；情节严重者，将被限制1年至2年内不得进入公路建设市场。
水利主管部门
- 监管范围：承担水利工程建设项目的监督管理职责，包括水库、河道治理等项目中的违法分包现象。
- 处罚措施：依据《水利建设市场主体信用信息管理办法》等相关规定，违法分包主体将受到信用惩戒等处理，并可能面临罚款、责令整改等具体行政处罚。
特殊专业工程监管部门
- 监管范围：如电力工程等特殊专业工程，由相应的专业监管机构（如电力监管机构）依照相关电力法规进行查处。
- 处罚依据：根据具体电力法规，违法分包行为将受到相应的行政处罚。
二、处罚流程
- 调查取证：建设行政主管部门在发现或接到举报后，会进行调查取证，收集相关证据材料。
- 审查处理：根据违法事实和证据进行审查，提出处理意见，并依据相关法律法规作出行政处罚决定。
- 告知权利：在作出行政处罚决定前，会告知当事人处罚的事实、理由、依据及其享有的陈述、申辩等权利。
- 组织听证：符合听证规定的，会组织听证，听取当事人的陈述和申辩意见。
- 送达决定：制作编有号码的行政处罚决定书，并按法律规定的方式送达当事人，确保当事人知晓处罚决定内容。
三、法律责任
- 行政处罚：依据违法情节轻重，违法分包者可能面临责令改正、没收违法所得、罚款、责令停业整顿、降低资质等级及吊销资质证书等处罚。
- 民事责任：因违法分包导致工程质量不合格而造成损失的，承包单位与分包单位应承担连带赔偿责任。
- 刑事责任：若因违法分包发生重大责任事故，相关主体还可能依法承担刑事责任。
四、建议与警示
鉴于违法分包行为的法律后果严重性，建议所有从事建筑工程活动的单位和个人严格遵守相关法律法规，坚决杜绝违法分包行为的发生。如需了解具体法律条文或处罚标准，或在实际操作中遇到法律问题，可以直接向我咨询，以确保自身行为的合法性与合规性。
综上所述，违法分包行为在建筑工程领域是严格禁止的，并受到多个政府部门的严格监管。各相关单位应严格遵守法律法规，共同维护建筑市场的健康与秩序。