违建持续行为的认定部门主要依据违建发生的地点、性质及违反的法律法规来确定，以下是对各部门职责的详细梳理：

1. 城市管理综合行政执法部门（城管执法局）：

   • 适用范围：在城市规划区内，对于未取得建设工程规划许可证或未按其规定进行建设的行为，城管执法部门有权进行调查、认定和处置。这包括市区内私自搭建的大型商业广告牌、违规加建的楼层等。
   • 法律依据：依据《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规，城管执法部门负责城市管理和行政执法工作，对城市建成区内的各类违法建设行为进行监管和认定。

2. 城乡规划主管部门：

   • 适用范围：主要负责城市、镇规划区内建筑物、构筑物等工程建设的规划管理。对于未取得或未按建设工程规划许可证进行的建设，该部门有权进行鉴定和处理。
   • 法律依据：《中华人民共和国城乡规划法》明确规定，县级以上地方人民政府城乡规划主管部门负责处理此类违建。例如，城市居民未经许可搭建阳光房，城乡规划主管部门将依据城市规划进行鉴定。

3. 乡、镇人民政府：

   • 适用范围：在乡、村庄规划区内，对于未依法取得或未按乡村建设规划许可证进行的建设，乡、镇人民政府具有鉴定权和处理权。这包括在农村集体土地上未经批准私自建设的住宅、养殖场等。
   • 法律依据：同样依据《中华人民共和国城乡规划法》，乡、镇人民政府可责令停止建设、限期改正，逾期不改则可拆除。

4. 自然资源部门（国土资源部门）：

   • 适用范围：针对未经批准非法占用土地进行建设的行为，自然资源部门负责认定和查处。若建设项目占用的土地不符合土地利用总体规划或未办理合法用地审批手续，自然资源部门将判定其为违建。例如，在农用地上违规建设工业厂房。
   • 法律依据：基于土地利用总体规划、土地用途管制等规定，自然资源部门对土地管理法律法规的遵守情况进行监管。

5. 水利部门：

   • 适用范围：对于在河道管理范围内违法建设建筑物、构筑物等影响行洪安全的行为，水利部门依据《中华人民共和国水法》《中华人民共和国防洪法》等法律法规进行认定和处理。河道内私自搭建房屋、围垦河道等行为均属于其管辖范畴。

法律建议与后果：

• 如果您面临违建持续行为的问题，首先应明确违建的具体地点、性质和违反的法律法规，以确定负责认定的主管部门。
• 违建行为可能面临责令停止建设、限期改正、罚款、没收违法所得、责令停业整顿、降低资质等级甚至吊销资质证书等处罚。情节严重的，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
• 因此，建议您在建设前务必了解并遵守相关法律法规，确保建设活动的合法性。如果遇到违建问题，应及时咨询相关部门或专业律师，以获取准确的指导和帮助。

总结：违建持续行为的认定部门因地域和具体情况而异，但主要集中在城市管理综合行政执法部门、城乡规划主管部门、乡（镇）人民政府以及特定情况下的自然资源部门和水利部门。如果您对违建问题存在疑问或需要法律建议，请直接向我咨询。