占用村集体几十年土地的处理方式需结合土地性质、占用主体及法律程序综合判断，核心结论如下：

1. 若土地为村集体所有且未办理合法流转手续

   • 法律定性：根据《土地管理法》第二条及第十一条，农村集体土地所有权归村集体所有，个人或单位未经法定程序（如承包、租赁、征收等）长期占用，属于侵权行为。
     
   • 处理方式：
     
     • 协商解决：村集体可与占用方协商，要求返还土地或补办合法手续（如签订租赁合同并支付租金）。
       
     • 行政处理：向乡镇人民政府或县级自然资源部门举报，要求责令退还土地。
       
     • 民事诉讼：村集体作为原告，以“排除妨害纠纷”或“返还原物纠纷”为案由，向法院起诉要求占用方返还土地并赔偿损失（如土地收益损失）。
       

2. 若土地已通过合法程序流转（如承包、租赁）但期限届满

   • 法律定性：根据《农村土地承包法》第二十一条及《民法典》第七百零五条，承包或租赁期限届满后，占用方需返还土地，继续占用需重新签订合同。
     
   • 处理方式：
     
     • 续期协商：村集体与占用方协商续签合同，明确期限、用途及费用。
       
     • 终止占用：若未达成续期协议，村集体可要求占用方限期腾退，逾期可强制清理或通过诉讼解决。
       

3. 若占用方主张“历史遗留问题”或“权属争议”

   • 法律定性：根据《土地管理法》第十四条，土地权属争议需由人民政府处理，当事人对处理结果不服的可提起行政诉讼。
     
   • 处理方式：
     
     • 权属确认：向县级人民政府申请土地权属争议调查处理，明确土地归属。
       
     • 证据固定：收集土地承包合同、缴费凭证、历史使用记录等证据，证明权属或占用合法性。
       

风险提示：

• 若占用方为村集体成员，需注意区分“家庭承包地”与“其他方式承包地”，前者受《农村土地承包法》特殊保护，解除合同需符合法定情形（如弃耕抛荒、改变用途等）。
  
• 若涉及征收补偿，需核查是否已签订补偿协议并履行，避免重复主张权利。
  

建议行动步骤：

1. 核查土地权属证明（如集体土地所有权证、承包合同）；
   
2. 固定占用事实证据（如现场照片、证人证言）；
   
3. 根据占用性质选择协商、行政投诉或诉讼路径；
   
4. 必要时委托律师介入，制定综合解决方案。
   

如有具体案情或证据材料，可进一步提供细节，我将结合实际情况分析。