核心结论：是否扣除自己垫付和保险公司垫付的金额，需根据具体情况判断，通常在最终赔偿计算时会进行相应处理，一般不会重复计算，但处理方式因赔偿项目和责任划分而有所不同。以下是具体分析：

1. 从赔偿项目角度分析
   • 医疗费：在交通事故赔偿中，医疗费是重要的赔偿项目之一。自己垫付的和保险公司垫付的医疗费，本质上都是用于治疗因交通事故受伤所产生的费用。在最终确定赔偿金额时，会将这些费用汇总计算总的医疗费损失。不过，在后续赔偿过程中，如果保险公司已经垫付了部分医疗费，在最终向责任方（如对方车主或其保险公司）索赔时，会扣除保险公司已垫付的部分，避免重复获赔。例如，受伤者总共花费医疗费5万元，保险公司前期垫付了2万元，自己垫付了3万元，那么在向责任方索赔时，主要是就这5万元的损失主张权利，但在实际获得赔偿时，会明确保险公司已垫付的2万元，责任方只需再支付剩余的3万元（假设责任方承担全部医疗费责任）。
   • 其他费用：除了医疗费，还可能有误工费、护理费、营养费等其他赔偿项目。自己垫付的和保险公司垫付的与这些费用相关的情况较少，但如果存在，同样遵循不重复计算的原则。比如，若保险公司垫付了部分护理费，在最终计算总的护理费赔偿时，会扣除已垫付部分。
2. 从责任划分角度分析
   • 己方全责：如果自己在交通事故中承担全部责任，那么自己垫付的费用和保险公司按照保险合同约定垫付的费用，在后续处理时，保险公司会根据保险条款进行理赔。对于自己垫付的部分，在符合保险理赔范围和条件的情况下，可以向保险公司申请报销，此时不会扣除自己垫付的合理费用，但会按照保险合同约定的赔偿比例等进行计算。例如，自己购买了车险中的车上人员责任险，自己垫付了医疗费等费用，在向保险公司申请理赔时，保险公司会根据保险金额和赔偿比例等确定最终赔偿给自己垫付费用的金额。
   • 对方全责：若对方在交通事故中承担全部责任，自己垫付的费用和对方保险公司垫付的费用，在最终赔偿时，对方保险公司会承担总的赔偿责任。自己垫付的费用可以要求对方保险公司进行赔偿，对方保险公司垫付的费用会从总的赔偿金额中扣除。比如，自己垫付了3万元医疗费，对方保险公司垫付了2万元，对方保险公司最终会根据责任认定和赔偿标准，确定总的赔偿金额（假设为8万元），那么在支付赔偿时，会扣除已垫付的2万元，再向自己支付剩余的6万元（其中包含自己垫付的3万元中应获赔偿的部分）。
   • 双方都有责任：当双方都有责任时，会按照责任比例来划分赔偿责任。自己垫付的费用和保险公司垫付的费用，在最终计算赔偿时，会根据责任比例进行分摊。例如，双方各承担50%的责任，自己垫付了4万元费用，对方垫付了2万元费用，那么在确定总的损失金额后，各自按照50%的比例承担赔偿责任，在支付赔偿时会扣除已垫付的部分进行结算。

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