当无主船舶在公告后有人认领时，处理流程通常遵循以下步骤，这些步骤基于相关法律法规及行政执法程序，以确保认领过程的合法性和公正性：
一、认领准备与提交材料
认领人准备：认领人需准备个人身份证明（如身份证）以及能够证明其对该船舶拥有所有权的材料，如船舶购买合同、船舶登记证书、船舶所有权证书等。
提交材料：认领人应在公告规定的期限内（如崇明海事局公告的六十日内或澄海区海洋综合执法大队公告的三十日内），携带上述材料到指定地点（如海事局或海洋综合执法大队）进行认领。
二、审核与调查
材料审核：相关部门会对认领人提交的材料进行审核，确认其真实性和合法性。这包括核对身份证明与所有权证明材料是否一致，以及证明材料是否完整、有效。
行政调查：在审核材料的同时，相关部门可能会对认领人进行进一步的行政调查，以了解船舶的历史使用情况、是否存在违法行为等。这有助于确保认领的船舶不涉及任何法律纠纷或违法行为。
三、认领确认与后续处理
认领确认：如果认领人提交的材料真实有效，且通过行政调查未发现任何问题，相关部门会确认认领人的所有权，并办理相应的认领手续。这可能包括签署认领协议、更新船舶登记信息等。
后续处理：认领成功后，认领人需按照相关规定对船舶进行合法使用和管理。如果船舶在认领前存在违法行为或需要接受处罚，认领人需承担相应的法律责任，并配合相关部门完成后续处理工作。
四、特殊情况处理
如果认领人提交的材料存在问题或无法通过行政调查：相关部门可能会拒绝认领申请，并告知认领人原因。此时，认领人可以补充材料或提出申诉，但需在规定时间内完成。
如果公告期满仍无人认领：相关部门会按照相关法律法规对船舶进行无主认定，并依法作出处置。这可能包括拍卖、拆解或用于其他公益目的等。
五、建议与注意事项
及时关注公告：对于可能拥有无主船舶所有权的人来说，及时关注相关公告并了解认领流程至关重要。
准备充分材料：在认领前，务必准备充分、真实的证明材料，以避免因材料不全或虚假而导致的认领失败。
配合调查：在认领过程中，积极配合相关部门的行政调查工作，如实提供相关信息和证据。
综上所述，当无主船舶在公告后有人认领时，相关部门会按照法律法规和行政执法程序进行审核、调查和确认工作。认领人需准备充分材料并积极配合调查工作，以确保认领过程的顺利进行。