若法院已判决被告开具增值税专用发票，被告应按照判决内容履行开具义务，若未履行，原告可申请法院强制执行。具体处理方式如下：

1. 被告履行判决义务：

   • 被告在收到法院判决后，应按照判决要求的时间和方式，向原告开具符合法律规定的增值税专用发票。
   • 增值税专用发票的开具需符合《中华人民共和国增值税暂行条例》及其实施细则的相关规定，包括发票的开具时间、内容、格式等。

2. 原告申请强制执行：

   • 若被告未在判决规定的期限内履行开具增值税专用发票的义务，原告有权向法院申请强制执行。
   • 申请强制执行时，原告需提交强制执行申请书、生效法律文书（即法院判决）等材料。
   • 法院在受理强制执行申请后，会依法采取强制措施，如查封、扣押、拍卖被告财产等，以迫使被告履行判决义务。

3. 税务机关协助执行：

   • 在执行过程中，若涉及增值税专用发票的开具，法院可与税务机关沟通协调，要求税务机关协助执行。
   • 税务机关可根据法院的要求，对被告的税务登记、发票领购、开具等情况进行监管，确保被告按照判决要求开具增值税专用发票。

4. 法律责任：

   • 若被告拒不履行法院判决，除承担强制执行的相关费用外，还可能面临罚款、拘留等法律责任。
   • 若被告的行为构成犯罪，如虚开增值税专用发票等，还将依法追究刑事责任。

建议：在处理此类案件时，原告应确保法院判决的明确性和可执行性，并在判决生效后及时与被告沟通，督促其履行开具增值税专用发票的义务。若被告拒不履行，原告应果断向法院申请强制执行，以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。