事业单位工作人员套取45000元工资属于违法行为，可能面临刑事处罚、行政处分及民事赔偿责任。具体分析如下：

1. 刑事责任
   根据《中华人民共和国刑法》第三百八十二条，套取国家财政资金（如工资）可能构成贪污罪。若行为人利用职务便利，通过虚报冒领、伪造凭证等手段非法占有公共财物，数额达到3万元以上即达到“数额较大”标准，可处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；若数额达到20万元以上，则属于“数额巨大”，可处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金或没收财产。本案中45000元已超过3万元，若证据充分，行为人可能被追究刑事责任。

2. 行政处分
   根据《事业单位工作人员处分暂行规定》第十八条，事业单位工作人员有贪污、索贿、受贿等行为的，给予警告或者记过处分；情节较重的，给予降低岗位等级或者撤职处分；情节严重的，给予开除处分。本案中套取工资行为属于“骗取财政资金”，若未达到刑事立案标准，单位可依据该规定给予行政处分，最高可至开除。

3. 民事赔偿
   套取的工资属于国家财产，行为人需承担返还义务。若单位已通过行政或刑事程序追缴款项，行为人仍需配合退赔；若未追缴，单位可单独提起民事诉讼要求返还。此外，若套取行为导致单位其他损失（如审计成本增加），行为人可能需承担额外赔偿责任。

建议：

• 行为人应主动退还违法所得，争取从轻处理；
  
• 单位应及时固定证据（如工资发放记录、伪造凭证等），并向纪检监察机关或公安机关报案；
  
• 若案件进入司法程序，行为人可委托律师辩护，争取减轻处罚（如自首、立功等情节）。
  

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