针对您提出的“检察院不起诉醉酒（这里主要指醉驾）怎么处理”的问题，我会从多个方面为您详细解答。
首先，我们需要明确的是，检察院不起诉醉驾并不意味着醉驾者无需承担任何后果。根据不同情况，检察院的不起诉决定可能分为法定不起诉、酌定不起诉和证据不足不起诉。
法定不起诉：
- 在这种情况下，检察院认为嫌疑人的行为不构成犯罪或不应追究刑事责任。
- 当事人会立即被释放，案件就此结束，且不会受到刑事处罚。
- 但需要注意的是，即使检察院不起诉，如果醉驾行为违反了《道路交通安全法》，交管部门仍可能对其进行行政处罚，如吊销驾照等。
酌定不起诉：
- 检察院认为犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚，因此作出不起诉决定。
- 在这种情况下，虽然当事人不会受到刑事处罚，但交管部门仍会依据《道路交通安全法》对其进行行政处罚，如吊销驾照，且五年内不得重新取得驾照，严重的话还可能面临罚款。
- 此外，醉驾记录可能会对当事人的职业准入、出国等方面产生影响，如某些岗位对有犯罪记录或违法记录的人员有限制，出国签证申请也可能因此受阻。
证据不足不起诉：
- 如果检察院认为证据不足，无法证明嫌疑人有罪，可能会作出不起诉决定。
- 但如果后续公安机关找到了新的证据，且符合起诉条件，案件可能会再次被送审。
- 在此期间，当事人需要留意公安机关是否有新的行政措施，并依规行事。
关于后续处理流程：
- 无论哪种不起诉情况，当事人都可以与承办检察院沟通确认具体程序细节。
- 如果被害人对检察院的不起诉决定不服，可以在收到不起诉决定书后七日以内向上一级人民检察院申诉，请求提起公诉。
- 被害人也可以不经申诉，直接向人民法院起诉。
关于案底问题：
- 一般情况下，检察院不起诉醉驾不会留下刑事案底，因为案底通常指的是犯罪记录，而检察院不起诉意味着案件不会进入法院审判程序，当事人未被法院判决有罪。
- 但如果是酌定不起诉，虽然不会留下刑事案底，但公安部门可能会留存相关违法记录，这些记录在特定情况下（如报考特殊岗位、参军等政审时）可能会有一定影响。
综上所述，即使检察院不起诉醉驾，醉驾者仍可能面临行政处罚和一定的社会影响。因此，我建议您在任何情况下都要严格遵守交通法规，切勿酒后驾车。如果您对检察院不起诉后的其他相关问题还有疑问，欢迎随时向我咨询。