针对公司厂房被法拍后，第三方建造的房屋如何分配的问题，这主要取决于房屋的产权归属以及法拍的具体情况，以下分情况讨论：

1. 房屋产权明确归属于公司：

   • 若第三方建造的房屋，其产权已经明确归属于公司（例如，公司委托第三方建造，且已办理相关产权手续），则该房屋作为公司资产的一部分，将随厂房一同被法拍。
   • 分配方式：法拍所得款项将按照公司债务的清偿顺序进行分配，包括但不限于偿还银行贷款、支付员工工资、缴纳税款等，剩余部分（如有）将按照公司章程或股东协议进行分配。

2. 房屋产权存在争议或未明确归属：

   • 若第三方建造的房屋产权存在争议（例如，第三方主张其拥有房屋产权，但未办理相关产权手续），或产权未明确归属于公司，则情况将更为复杂。
   • 处理方式：
     • 协商解决：首先，可以尝试与第三方协商，达成产权归属或补偿协议，以明确房屋在法拍中的处理方式。
     • 法律程序：若协商无果，可能需要通过法律程序（如诉讼、仲裁）来确定房屋产权归属。在此期间，法拍程序可能会暂停或中止，直至产权问题得到解决。
     • 分配影响：若最终确定房屋产权归属于第三方，则该房屋将不被纳入法拍范围；若确定归属于公司，则按上述第一种情况处理。

3. 第三方建造房屋但未办理产权手续，且公司未支付建造费用：

   • 在这种情况下，第三方可能主张其对房屋拥有某种权益（如留置权、建设工程价款优先受偿权等）。
   • 处理方式：
     • 优先受偿：根据相关法律规定，建设工程价款可能享有优先受偿权。这意味着在法拍所得款项中，应优先支付第三方的建造费用。
     • 剩余款项分配：支付完第三方建造费用后，剩余款项将按照公司债务的清偿顺序进行分配。

4. 特殊情况：房屋为违法建筑：

   • 若第三方建造的房屋为违法建筑（如未取得建设工程规划许可证），则该房屋可能无法被纳入法拍范围。
   • 处理方式：违法建筑通常会被要求拆除或没收，因此不会产生法拍所得款项。在此情况下，公司可能需要与第三方协商解决拆除或没收后的相关问题。

法律建议：

• 在处理此类问题时，建议公司首先进行产权调查，明确房屋的产权归属。
• 若产权存在争议或未明确归属，应及时与第三方协商或寻求法律帮助，以避免法拍程序中的不确定性和风险。
• 在法拍过程中，应密切关注法拍公告和相关法律程序，确保公司的合法权益得到保障。

后续行动建议：

• 若您面临此类问题，建议立即咨询专业律师，进行详细的法律分析和策略制定。
• 同时，收集并整理相关证据材料（如建造合同、付款凭证、产权证书等），以便在协商或法律程序中维护公司的合法权益。

有问题可以直接向我咨询，我会结合您的具体情况，给出更详细的法律建议。