结论：在工程一切险中，若因设计缺陷导致事故但无法出具证明，保险公司通常不会直接赔付，但具体能否获得赔偿需结合保险合同条款、事故调查情况及法律适用综合判断。以下分情况详细说明：

1. 保险合同条款的直接影响

• 免责条款：工程一切险的保险合同中通常会明确“设计缺陷”属于免责范围（即保险公司不承担赔偿责任）。若合同中明确将“因设计错误、缺陷或不符合规范导致的事故”列为除外责任，且您无法提供证明设计缺陷的直接证据（如第三方鉴定报告、设计单位自认文件等），保险公司有权拒赔。
• 举证责任：根据《保险法》第22条，投保人/被保险人需提供与确认保险事故性质、原因、损失程度等有关的证明和资料。若无法证明事故由设计缺陷导致，保险公司可能以“证据不足”为由拒赔。

2. 无法出具证明的实务处理

• 事故调查的替代证据：若无法直接证明设计缺陷，但可通过其他证据间接推定（如施工记录显示按图施工但结构仍倒塌、同类工程无类似问题等），可尝试通过事故调查报告、专家意见等材料主张设计缺陷与事故的因果关系。但此类证据的证明力较弱，保险公司可能不认可。
• 保险公司的调查义务：根据《保险法》第23条，保险公司收到赔偿请求后，应及时核定；情形复杂的，应在30日内核定。若保险公司未履行调查义务，或调查结论明显不合理，您可通过诉讼主张其承担赔偿责任。

3. 法律适用与诉讼路径

• 因果关系认定：若设计缺陷是事故的“近因”（即直接、有效原因），且能通过间接证据证明，法院可能突破合同条款限制，判决保险公司赔付（尤其当免责条款存在歧义或未尽到提示说明义务时）。
• 举证责任倒置：在特定情况下（如保险公司主张事故由其他原因导致），可能适用举证责任倒置，即由保险公司证明事故与设计缺陷无关。但此类情形需结合具体案情判断。

4. 实务建议

• 立即固定证据：即使无法出具直接证明，也应尽快收集施工记录、监理报告、事故现场照片等材料，为后续主张提供支持。
• 协商与投诉：可先与保险公司协商，要求其说明拒赔理由；若协商无果，可向当地银保监会投诉，要求调解。
• 诉讼准备：若争议较大，建议委托律师分析合同条款、证据效力，并评估诉讼风险。

总结：无法出具设计缺陷证明时，保险公司通常拒赔，但若能通过间接证据证明因果关系，或保险公司未履行调查义务，仍可能通过法律途径获得赔偿。具体需结合合同条款、证据情况及法律适用综合判断。如有进一步问题，可直接向我咨询。