建筑工程施工合同需要备案，且在工程竣工验收合格后需办理相关备案手续。以下是对这一问题的详细分析：

一、建筑工程施工合同备案的法律依据

根据《建设工程质量管理条例》的相关规定，建设单位在收到建设工程竣工报告后，应组织设计、施工、工程监理等有关单位进行竣工验收。验收合格后，建设单位需在15日内，将建设工程竣工验收报告和规划、公安消防、环保等部门出具的认可文件或者准许使用文件，报建设行政主管部门或者其他有关部门备案。这一规定明确了建筑工程施工合同在竣工验收后需要办理备案手续的要求。

二、备案的重要性及法律后果

1. 备案的重要性：

   • 备案是建设行政主管部门对建设工程质量进行监督管理的重要环节。
   • 备案有助于确保建设工程的合法性和合规性，保护各方当事人的合法权益。
   • 备案后的合同内容具有更高的法律效力，尤其在合同纠纷处理中，备案合同往往作为结算工程价款的依据。

2. 未备案的法律后果：

   • 虽然未备案的施工合同本身并不影响其效力，但在合同纠纷处理中，未备案的合同可能面临更多的法律风险和不确定性。
   • 如果建设单位在竣工验收过程中有违反国家有关建设工程质量管理规定的行为，建设行政主管部门有权责令停止使用，并重新组织竣工验收。

三、备案的具体流程和要求

1. 备案时间：建设单位应在建设工程竣工验收合格之日起15日内办理备案手续。
2. 备案材料：包括建设工程竣工验收报告、规划、公安消防、环保等部门出具的认可文件或者准许使用文件等。
3. 备案机构：建设行政主管部门或者其他有关部门是负责办理备案手续的机构。

四、关于施工合同内容变更的备案

如果在初次备案之后，合同双方协商变更了合同的内容，也依旧需要再次办理备案手续。这是为了确保备案合同的准确性和时效性，保护各方当事人的合法权益。

五、实际案例与法律适用

在实际操作中，如果有一份施工合同与已经备案了的施工合同内容不一致，根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》的相关规定，应当以备案后的合同内容为准。这进一步强调了备案合同在法律纠纷处理中的重要性。

建议：作为建设单位或施工单位，在签订建筑工程施工合同时，应充分了解并遵守相关法律法规关于备案的要求。在合同履行过程中，如需变更合同内容，也应及时办理备案手续，以确保合同的合法性和有效性。如果有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。