行政部门处理知识产权纠纷的法律依据主要来源于相关法律法规，这些法规明确了行政部门的职权范围、处理程序以及法律责任。以下从不同角度为您详细阐述：
一、主要法律依据
《中华人民共和国专利法》
- 该法规定了专利权的授予条件、保护范围以及侵权行为的法律责任。在专利纠纷中，行政部门（如国家知识产权局或地方知识产权管理部门）有权根据申请人的请求，对专利侵权行为进行调查和处理，包括责令侵权人停止侵权行为、没收违法所得以及罚款等。
《中华人民共和国商标法》
- 商标法明确了商标的注册、使用、保护以及侵权行为的法律责任。对于商标侵权纠纷，行政部门（如国家工商行政管理总局商标局或地方工商行政管理部门）有权进行查处，包括责令立即停止侵权行为、没收、销毁侵权商品和主要用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具，以及处以罚款等。
《中华人民共和国著作权法》
- 著作权法规定了著作权的保护范围、侵权行为的认定以及法律责任。在著作权纠纷中，虽然主要处理途径是民事诉讼，但行政部门（如国家版权局或地方版权管理部门）也有权对某些侵权行为进行查处，特别是涉及公共利益的侵权行为。
《中华人民共和国反不正当竞争法》
- 该法规定了不正当竞争行为的种类、法律责任以及行政部门的查处职权。对于涉及知识产权的不正当竞争行为，如假冒他人注册商标、擅自使用知名商品特有的名称、包装、装潢等，行政部门有权进行查处。
二、行政部门处理知识产权纠纷的程序
受理与调查
- 行政部门在接到知识产权纠纷的投诉或举报后，会进行初步审查，决定是否受理。受理后，会进行调查取证，包括询问当事人、查阅相关文件、现场勘查等。
处理决定
- 根据调查结果，行政部门会作出处理决定。对于侵权行为，会责令侵权人停止侵权行为，并可能处以罚款、没收违法所得等行政处罚。对于构成犯罪的，会移送司法机关追究刑事责任。
复议与诉讼
- 当事人对行政部门的处理决定不服的，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。行政复议是向上一级行政部门提出，而行政诉讼则是向人民法院提起。
三、行政部门处理知识产权纠纷的优势与局限
优势
- 效率高：行政部门在处理知识产权纠纷时，通常具有较快的处理速度，能够及时制止侵权行为。
- 专业性强：行政部门的工作人员通常具备专业的知识产权知识，能够准确认定侵权行为。
- 成本低：与民事诉讼相比，行政处理通常不需要支付高额的诉讼费用。
局限
- 处罚力度有限：行政部门的处罚力度通常不如司法机关，对于某些严重的侵权行为可能无法起到足够的震慑作用。
- 救济途径有限：当事人对行政处理决定不服的，只能通过行政复议或行政诉讼进行救济，途径相对有限。
在实际操作中，如果您遇到知识产权纠纷，并希望行政部门进行处理，建议首先了解相关法律法规，明确自己的权利和义务。同时，也可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。