违反《村民委员会组织法》第二十四条签订的协议，在特定情况下是无效的。以下是对这一问题的详细分析：

一、协议无效的法律依据

根据《民法典》的相关规定，合同无效的情形包括主体不适格、意思表示不真实、内容违法以及违反法定程序等。具体到《村民委员会组织法》第二十四条，该条款明确规定了涉及村民利益的特定事项，必须经村民会议讨论决定方可办理。这些事项包括但不限于土地承包经营方案、村集体经济项目的立项与承包方案、宅基地的使用方案、征地补偿费的使用与分配方案，以及以借贷、租赁或其他方式处分村集体财产等。若村委会未经村民会议讨论决定，擅自就上述事项签订协议，则该协议可能因违反法定程序而无效。

二、协议无效的具体情形

1. 未经村民会议讨论决定：

   • 若协议涉及《村民委员会组织法》第二十四条所列举的村民利益事项，且未经村民会议讨论决定，则该协议可能无效。例如，村委会未经村民会议讨论决定，擅自将村集体土地出租给他人，该租赁合同即可能因违反法定程序而无效。

2. 超越职责和权限范围：

   • 村委会作为基层群众性自治组织，其职责和权限范围由法律、法规明确规定。若村委会超越其职责和权限范围签订协议，如未经授权擅自处分国家所有的土地，则该协议可能因主体不适格而无效。

3. 意思表示不真实：

   • 协议的签订必须是双方自愿、真实的意愿表达。若一方以欺诈、胁迫的手段订立协议，或乘人之危使对方在违背真实意思的情况下订立协议，则该协议可能因意思表示不真实而无效。

4. 内容违法：

   • 协议内容必须符合法律规定，不得违反法律、行政法规的强制性规定。若协议内容违法，如约定的事项违反土地管理法、环境保护法等，则该协议可能因内容违法而无效。

三、实务建议

1. 审查协议内容：

   • 在与村委会签订协议前，应仔细审查协议内容，确保其不涉及《村民委员会组织法》第二十四条所列举的村民利益事项，或虽涉及但已按法定程序经村民会议讨论决定。

2. 要求提供书面文件：

   • 若协议涉及村民利益事项，应要求村委会提供经村民会议讨论通过的书面文件，以确保协议的有效性。

3. 及时寻求法律援助：

   • 若发现协议可能无效或存在争议，应及时寻求法律援助，通过法律途径维护自身合法权益。

举例说明：假设某村委会未经村民会议讨论决定，擅自将村集体所有的土地出租给某企业用于非农建设。后因租金支付问题发生纠纷，企业主张租赁合同有效并要求村委会继续履行合同。在此情况下，由于租赁合同涉及村民利益事项且未经村民会议讨论决定，违反了《村民委员会组织法》第二十四条的规定，因此该租赁合同可能无效。企业无法依据无效合同要求村委会继续履行合同或支付租金。

综上所述，违反《村民委员会组织法》第二十四条签订的协议，在特定情况下是无效的。在签订协议时，务必确保协议内容合法、程序合规，以维护自身合法权益。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。