在开标过程中，如果及时回复了询问函，通常不会被废标。不过，是否会被废标还需结合具体情况来分析，以下从不同角度进行说明：

1. 及时回复询问函的积极意义

在开标过程中，招标方可能会就投标文件中的某些内容向投标方发出询问函，要求投标方对特定问题进行澄清或说明。如果投标方能够及时、准确地回复询问函，这通常被视为投标方积极配合招标流程、遵守招标规则的表现。及时回复有助于消除招标方对投标文件的疑虑，增加投标文件被接受的可能性。

2. 废标的法定情形

根据相关法律法规，废标通常发生在以下情形：

• 投标文件不符合招标文件要求：如投标文件未按照招标文件的要求进行编制、未提供必要的证明文件或资料等。
• 投标方存在违法行为：如投标方在招标过程中存在行贿、串通投标等违法行为。
• 投标报价超出预算或明显不合理：如投标报价远高于市场平均水平或明显低于成本价，且无法提供合理解释。
• 其他法定废标情形：如招标项目发生重大变更，导致原招标文件无法继续适用等。

及时回复询问函并不属于上述废标的法定情形。因此，从法律角度来看，及时回复询问函本身不会导致废标。

3. 特殊情况下的考虑

尽管及时回复询问函通常不会被废标，但在某些特殊情况下，仍需谨慎对待：

• 回复内容不准确或存在误导：如果投标方在回复询问函时提供了不准确或误导性的信息，这可能会引发招标方的进一步质疑，甚至导致废标。
• 回复时间过晚：虽然“及时”是一个相对主观的概念，但如果投标方在招标方规定的回复期限之后才提交回复，这可能会被视为不遵守招标规则，从而影响投标结果。
• 招标方对回复内容不满意：在某些情况下，即使投标方及时回复了询问函，但如果招标方对回复内容不满意或认为回复未能充分解决问题，招标方仍可能选择废标。

4. 建议与注意事项

• 确保回复的准确性和完整性：投标方在回复询问函时，应确保回复内容的准确性和完整性，避免提供不准确或误导性的信息。
• 遵守回复期限：投标方应严格遵守招标方规定的回复期限，确保在规定时间内提交回复。
• 保持与招标方的沟通：在回复询问函的过程中，投标方可以保持与招标方的沟通，及时了解招标方的需求和期望，以便更好地调整回复内容。

总结来看，在开标过程中及时回复询问函通常不会被废标。但投标方仍需确保回复的准确性、完整性和及时性，以避免因回复不当而引发不必要的风险。如果您在开标过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。