企业擅自变更住所，由原登记机关或实际经营地所在的市场监管部门处理。具体分析如下：
一、法律依据
根据《中华人民共和国公司法》第三十四条第一款：“公司登记事项发生变更的，应当依法办理变更登记。”以及第二百六十条第二款：“公司登记事项发生变更时，未依照本法规定办理有关变更登记的，由公司登记机关责令限期登记；逾期不登记的，处以一万元以上十万元以下的罚款。”企业若擅自变更住所而未办理变更登记，将面临市场监管部门的处罚。
二、处理部门
原登记机关：
- 企业最初注册时，会在某一市场监管部门（即原登记机关）进行登记。若企业擅自变更住所而未办理变更登记，原登记机关有权对此进行查处。
- 例如，在杭州市上城区市场监管局查处的案例中，该局作为原登记机关，对未办理变更登记而擅自变更住所的企业进行了处罚。
实际经营地所在的市场监管部门：
- 在某些情况下，企业可能已迁至其他地区开展实际经营活动，但未办理变更登记。此时，实际经营地所在的市场监管部门也有权对此进行查处。
- 这是因为，实际经营地所在的市场监管部门更便于对企业进行日常监管和检查，确保企业合法合规经营。
三、法律建议
及时办理变更登记：
- 企业在变更住所时，应及时向原登记机关申请办理变更登记手续，确保经营合法合规。
- 变更登记不仅有助于企业避免法律风险，还能提升企业的信誉度和市场竞争力。
配合市场监管部门的调查：
- 若企业接到市场监管部门的调查通知或责令改正通知书，应积极配合调查，按照要求提供相关证据和资料。
- 拒绝配合或隐瞒事实真相，将可能面临更严重的法律后果。
寻求专业法律帮助：
- 若企业在变更住所或办理变更登记过程中遇到法律问题，可寻求专业律师的帮助。
- 律师能够为企业提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助企业解决法律问题，维护企业的合法权益。
企业擅自变更住所而未办理变更登记是违法行为，将面临市场监管部门的处罚。因此，企业应严格遵守相关法律法规，及时办理变更登记手续，确保经营合法合规。如有任何法律问题，可直接向我咨询。