交通事故司法鉴定后二次手术住院的三期（误工期、护理期、营养期）费用，通常应当在鉴定之外获得赔偿，但具体需视鉴定报告的内容和范围而定。以下从不同角度为您详细分析：

1. 鉴定报告未涵盖二次手术三期的情况

• 法律原则：根据《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》等相关规定，受害人因交通事故遭受人身损害，因就医治疗支出的各项费用以及因误工减少的收入，包括医疗费、误工费、护理费、营养费等，赔偿义务人应当予以赔偿。
• 具体分析：如果司法鉴定报告仅针对首次手术的三期进行了鉴定，而未涵盖二次手术的三期，那么受害人有权就二次手术的三期费用另行主张赔偿。这是因为二次手术是首次手术的延续，且因交通事故直接导致，相关费用应由赔偿义务人承担。
• 建议：在此情况下，受害人可以委托专业机构对二次手术的三期进行重新鉴定，并据此向赔偿义务人主张赔偿。

2. 鉴定报告已涵盖二次手术三期的情况

• 法律原则：同样依据上述法律规定，如果司法鉴定报告已经明确包含了二次手术的三期费用，那么受害人通常无需再就这部分费用另行主张赔偿。
• 具体分析：鉴定报告作为专业机构出具的专业意见，具有较高的证明力。如果报告已经全面考虑了受害人的伤情、治疗情况以及后续可能需要的二次手术等因素，并据此给出了三期的鉴定意见，那么赔偿义务人应按照鉴定报告的结果进行赔偿。
• 建议：受害人应仔细审查鉴定报告的内容，确保报告已经全面、准确地反映了其伤情和治疗情况。如果发现报告存在遗漏或错误，应及时与鉴定机构沟通并申请补充鉴定或更正。

3. 特殊情况下的处理

• 鉴定报告存在争议：如果双方对鉴定报告的内容存在争议，特别是关于二次手术三期的鉴定部分，那么可以通过协商、调解或诉讼等方式解决争议。在诉讼过程中，法院可能会委托更高级别的鉴定机构进行重新鉴定。
• 赔偿义务人拒绝赔偿：如果赔偿义务人拒绝按照鉴定报告的结果进行赔偿，受害人可以通过法律途径维护自己的合法权益。这包括向法院提起诉讼、申请强制执行等。

4. 实际操作中的注意事项

• 及时鉴定：受害人应在治疗终结后及时委托专业机构进行三期鉴定，以确保鉴定结果的准确性和时效性。
• 保留证据：受害人应妥善保管与交通事故相关的所有证据，包括医疗记录、费用单据、鉴定报告等，以便在主张赔偿时提供有力支持。
• 专业咨询：在处理交通事故赔偿问题时，受害人可以咨询专业律师的意见，以确保自己的合法权益得到充分保障。

总结来看，交通事故司法鉴定后二次手术住院的三期费用是否应当在鉴定之外获得赔偿，取决于鉴定报告的内容和范围。如果鉴定报告未涵盖二次手术的三期，受害人有权另行主张赔偿；如果已涵盖，则通常无需再主张。在实际操作中，受害人应仔细审查鉴定报告、及时鉴定、保留证据，并在必要时咨询专业律师的意见。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。