针对甲方房屋出租给乙方，且甲方房屋存在纠纷时合同应如何撰写的问题，以下是我从专业角度给出的详细建议：
一、合同基本框架与核心要素
合同双方信息：
- 甲方（出租方）信息：需详细列明姓名/名称、身份证号码/统一社会信用代码、住所/地址、联系电话。
- 乙方（承租方）信息：同样需详细列明姓名/名称、身份证号码/统一社会信用代码、住所/地址、联系电话。
房屋基本情况：
- 详细描述房屋位置、面积、装修及设施状况，可附清单作为合同附件。
- 明确房屋用途（如居住、商用等），以避免后续因使用性质产生的争议。
租赁期限：
- 明确租赁期限的具体起止日期，租赁期限不得超过二十年，续租需重新约定且不超过二十年。
- 规定续租的条件和程序，避免不定期租赁带来的不确定性。
租金及支付方式：
- 约定租金数额、支付周期（如月付、季付）及支付方式（如银行转账）。
- 明确逾期支付的后果（如逾期利息、解除合同等），确保甲方权益得到保障。
二、针对房屋存在纠纷的特别条款
纠纷说明与责任划分：
- 在合同中明确说明房屋存在的纠纷情况，包括纠纷的性质、当前状态及可能的影响。
- 划分因纠纷导致的责任，如因纠纷导致乙方无法正常使用房屋，甲方应承担的责任及赔偿方式。
纠纷解决方式：
- 约定纠纷的解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。
- 明确双方在纠纷解决过程中的权利与义务，以及纠纷解决后合同的继续履行或终止方式。
合同解除与终止条件：
- 规定因纠纷导致合同无法继续履行时，双方解除合同的条件和程序。
- 明确合同解除后房屋的返还要求、租金及押金的退还方式等。
三、其他重要条款
维修与保养责任：
- 明确房屋及其附属设施的维修和保养责任，避免后续因维修问题产生的争议。
- 规定承租人对房屋进行改善或增设他物时需提前征得甲方同意，以及未经同意的处理方式。
押金条款：
- 约定押金的数额、支付方式及退还条件。
- 明确押金用于抵扣的费用范围，如租金逾期、房屋损坏等。
违约责任：
- 详细规定双方违约时的责任承担方式，包括违约金数额、赔偿范围等。
- 确保违约责任条款具有可执行性，避免过于笼统或难以实现。
四、合同撰写示例（部分条款）
房屋纠纷说明与责任划分：
甲方确认，本房屋存在XX纠纷（如产权纠纷、相邻关系纠纷等），目前纠纷状态为XX（如正在诉讼中、已达成和解等）。因纠纷导致乙方无法正常使用房屋的，甲方应承担以下责任：
- 为乙方提供同等条件的替代房屋供乙方使用，直至原房屋纠纷解决。
- 减免乙方因纠纷无法使用房屋期间的租金。
- 赔偿乙方因纠纷导致的其他直接损失（如搬迁费用、临时住宿费用等）。
纠纷解决方式：
双方因本房屋纠纷产生争议的，应首先通过友好协商解决；协商不成的，可向房屋所在地的人民调解委员会申请调解；调解不成的，可向房屋所在地的人民法院提起诉讼。
五、注意事项
- 合同内容的合法性：确保合同内容符合《中华人民共和国民法典》等相关法律法规的规定，避免出现违法条款。
- 合同条款的明确性：合同条款应清晰明了、具体详细，避免出现模糊不清或容易产生歧义的表述。
- 合同签署的规范性：双方应在合同上签字或盖章，并注明签署日期。如为电子合同，应使用可靠的电子签名并确保合同内容的完整性和不可篡改性。
在撰写合同时，建议甲方充分披露房屋存在的纠纷情况，并与乙方协商确定合理的责任划分和纠纷解决方式。如有需要，您可以进一步向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。