针对建设单位、总包单位与分包单位之间的合同纠纷，主要涉及以下法律条款及适用要点：

一、核心法律条款

1. 《中华人民共和国民法典》合同编

   • 合同效力与履行：第791条明确禁止承包人将主体结构施工分包给第三人，违反该规定的分包行为无效。同时，规定了分包合同的订立、履行、变更、解除及违约责任等原则性内容。
   • 连带责任：若总承包人或勘察、设计、施工承包人经发包人同意，将部分工作交由第三人完成，第三人就其完成的工作成果与总承包人或勘察、设计、施工承包人向发包人承担连带责任。
   • 合同解除：第806条规定，承包人将建设工程转包、违法分包的，发包人可以解除合同。合同解除后，已完成且质量合格的部分，发包人应支付相应工程价款。

2. 《中华人民共和国建筑法》

   • 分包管理：第29条规定，建筑工程总承包单位可以将部分工程发包给具有相应资质的分包单位，但除总承包合同中约定的分包外，必须经建设单位认可。同时，禁止总承包单位将工程分包给不具备相应资质条件的单位，也禁止分包单位将其承包的工程再分包。
   • 连带责任：总承包单位和分包单位就分包工程对建设单位承担连带责任，确保工程质量与安全。

3. 《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》

   • 合同无效情形：细化了分包合同无效的具体情形，如无资质、超越资质等级、借用资质等违法分包行为。
   • 实际施工人权益保护：允许实际施工人以发包人为被告主张工程款，突破合同相对性原则，有效维护农民工等实际施工人的权益。
   • 质量责任与工程款结算：明确了总分包单位在质量问题上的责任承担方式，以及工程款结算的原则和程序。

二、法律适用要点

1. 合同效力审查

   • 核查分包人是否具备法定资质，是否存在转包、肢解分包等违法行为。例如，若分包企业未取得专业承包资质，其签订的合同将被认定为无效。

2. 责任承担规则

   • 在质量缺陷情况下，总承包单位需先行承担责任，后可向有过错的分包单位追偿。在工程款纠纷中，应优先保障农民工工资支付，再处理总分包间的结算争议。

3. 举证责任分配

   • 分包人需证明已完工程量及价款，总承包人则要举证证明分包人存在违约行为或质量问题。例如，防水工程分包商主张工程款时，需提供经监理确认的验收记录等证据。

三、实务建议

1. 合同签订阶段

   • 确保合同主体适格、条款完备，明确付款节点、验收标准、违约责任等关键内容。
   • 避免签订阴阳合同，严格履行招投标程序，确保合同合法有效。

2. 履约管理阶段

   • 保留签证单、会议纪要、往来函件等证据，以备不时之需。
   • 定期核对工程量，及时确认变更事项，避免产生纠纷。

3. 争议解决阶段

   • 优先选择仲裁方式解决争议，因其保密性强、效率高。但需注意，仲裁需事先约定仲裁条款。
   • 若选择诉讼方式，需注意诉讼时效问题。普通诉讼时效为3年，而工程款优先受偿权的行使期限为6个月（自竣工或约定竣工日起算）。

在处理此类合同纠纷时，建议各方当事人充分了解相关法律条款和适用要点，积极收集证据，并在必要时寻求专业律师的帮助，以维护自身合法权益。如有任何法律问题，都可以直接向我咨询。