核心结论：连锁药房被收购后，供货商货款的支付问题需根据收购类型、合同条款及法律规定综合判断，通常有以下几种处理方式。

1. 收购类型决定货款支付责任

• 资产收购：若收购方仅购买药房的资产（如库存、设备），而未承接其债务，则原药房（被收购方）仍需承担供货商货款支付责任。此时，供货商应向原药房主张债权，若原药房已注销或无力支付，可能面临坏账风险。
• 股权收购：若收购方通过购买药房股权成为新股东，通常需承接药房的全部债权债务（包括供货商货款）。此时，供货商可直接向收购方（新药房）主张货款，收购方不得以“未参与原合同”为由拒绝支付。
• 特殊约定：若收购协议中明确约定货款支付责任由原药房或第三方承担（如原股东担保），则需按协议执行。供货商应仔细审查收购协议条款，必要时要求收购方提供担保或第三方承诺。

2. 合同条款是关键依据

• 供货合同主体：若供货合同是与药房母公司或关联方签订，而非被收购的子公司，则收购可能不影响货款支付责任。此时，供货商应继续向合同相对方主张债权。
• 合同变更条款：若供货合同中约定“合同主体变更需双方同意”，而收购方未与供货商协商变更合同，则供货商有权拒绝向收购方履行供货义务，并要求原药房继续支付货款。
• 付款条件：若合同约定货款支付与药房经营状况挂钩（如“销售后付款”），则收购后药房的经营模式变化可能影响付款时间。供货商需关注收购后药房的运营情况，及时主张权利。

3. 法律保护与救济途径

• 债权申报：若原药房进入破产程序，供货商应作为债权人向管理人申报债权，参与破产分配。
• 诉讼维权：若收购方或原药房拒不支付货款，供货商可向法院起诉，要求支付货款及违约金。诉讼中需提供供货合同、送货单、对账单等证据。
• 行使留置权：若供货商保留货物所有权（如“货到付款”未履行），可在药房未支付货款时行使留置权，拒绝交付货物或要求折价补偿。

4. 实务建议

• 及时沟通：收购发生后，供货商应主动与收购方、原药房沟通，明确货款支付责任主体及时间。
• 审查文件：要求收购方提供收购协议、工商变更登记等文件，确认收购类型及债务承接情况。
• 保留证据：妥善保管供货合同、送货单、发票、对账单等证据，以备维权之需。

总结：连锁药房被收购后，供货商货款的支付责任需结合收购类型、合同条款及法律规定综合判断。建议供货商及时审查相关文件，与收购方沟通确认责任主体，必要时通过法律途径维权。如有具体案件或合同条款需进一步分析，可直接向我咨询。