修理厂偷换发动机并改码的行为是违法的，以下从不同角度为您详细分析：
一、法律定性
侵犯财产权：
- 发动机作为车辆的重要组成部分，其所有权归车主所有。修理厂未经车主同意，擅自偷换发动机，侵犯了车主的财产权。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，物权的取得和行使应当遵守法律，尊重社会公德，不得损害公共利益和他人合法权益。修理厂的行为显然违反了这一原则。
欺诈行为：
- 修理厂在偷换发动机后，还可能通过改码等手段掩盖真相，使车主在不知情的情况下继续使用被偷换的发动机。这种行为构成欺诈，违反了《中华人民共和国消费者权益保护法》中关于经营者不得作虚假或者引人误解的宣传的规定。车主有权要求修理厂承担欺诈行为的法律责任。
可能涉及刑事犯罪：
- 如果修理厂偷换发动机的行为情节严重，如涉及大量车辆、造成重大财产损失或人身伤害等，还可能构成刑事犯罪。例如，可能涉嫌盗窃罪（如果发动机被非法占有并出售）、破坏交通工具罪（如果偷换发动机导致车辆性能下降，危及行车安全）等。
二、法律后果
民事责任：
- 车主有权要求修理厂赔偿因偷换发动机造成的损失，包括发动机的差价、维修费用、车辆贬值损失等。同时，车主还可以要求修理厂承担因欺诈行为导致的精神损害赔偿。
行政责任：
- 如果修理厂的行为违反了相关行政法规，如《中华人民共和国道路交通安全法》等，还可能面临行政处罚，如罚款、吊销营业执照等。
刑事责任：
- 如前所述，如果修理厂的行为构成刑事犯罪，将面临刑事责任的追究。这可能包括有期徒刑、罚金等刑罚。
三、建议与措施
保留证据：
- 车主在发现发动机被偷换后，应立即保留相关证据，如维修记录、发票、照片、视频等。这些证据将有助于车主在后续的法律纠纷中维护自己的权益。
与修理厂协商：
- 车主可以尝试与修理厂进行协商，要求其赔偿损失并恢复原状。如果协商无果，车主可以考虑采取法律手段维护自己的权益。
寻求法律帮助：
- 车主可以咨询专业律师（比如我），了解自己的法律权益和维权途径。律师将根据具体情况为车主提供法律建议和帮助。
向相关部门投诉：
- 车主还可以向相关行政部门（如市场监督管理局、交通运输管理部门等）投诉修理厂的行为。这些部门将对投诉进行调查并依法处理。
总结来说，修理厂偷换发动机并改码的行为是违法的，车主有权要求修理厂承担相应的法律责任。如果您遇到此类问题，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。