种子质量的鉴定通常由专业的种子检验机构或县级以上地方人民政府农业行政主管部门所属的种子管理机构进行。以下是对此问题的详细解析：
一、鉴定机构的选择
专业种子检验机构：
- 这些机构具备专业的检测设备和人员，能够对种子的纯度、净度、发芽率、水分等核心指标进行准确检测。
- 农户或种子生产者、经营者在怀疑种子存在质量问题时，可以选择此类机构进行鉴定。
县级以上地方人民政府农业行政主管部门所属的种子管理机构：
- 根据《农作物种子质量纠纷田间现场鉴定办法》，此类机构负责组织现场鉴定，以确定事故原因或损失程度。
- 当双方当事人对种子质量纠纷的原因或损失程度存在分歧时，可以向此类机构申请现场鉴定。
二、鉴定流程
申请鉴定：
- 种子质量纠纷处理机构或当事人可以共同或单独向种子管理机构提出鉴定申请。
- 申请一般以书面形式提出，说明鉴定的内容和理由，并提供相关材料。口头提出鉴定申请的，种子管理机构应当制作笔录，并请申请人签字确认。
审查与受理：
- 种子管理机构对申请人的申请进行审查，符合条件的，应当及时组织鉴定。
- 有特定情形（如作物生长期已错过典型性状表现期、司法机构已做出生效判决等）的，种子管理机构对现场鉴定申请不予受理。
组织鉴定：
- 种子管理机构组织专家鉴定组进行现场鉴定。专家鉴定组由鉴定所涉及作物的育种、栽培、种子管理等方面的专家组成。
- 专家鉴定组根据现场情况确定取样方法和鉴定步骤，并独立进行现场鉴定。
出具鉴定报告：
- 专家鉴定组完成鉴定后，会出具鉴定报告，明确种子是否存在质量问题以及问题的性质和程度。
三、法律后果与责任
若种子存在质量问题：
- 根据《中华人民共和国种子法》及相关规定，种子生产者或经营者需承担相应的赔偿责任。
- 赔偿责任包括直接损失（如购买种子的价款）和可得利益损失（如因种子质量问题导致的农作物减产、绝收等预期收益损失）。
若对鉴定结果有异议：
- 被检查人对检测结果有异议的，可以申请复检。复检不得采用同一检测方法。
- 因检测结果错误给当事人造成损失的，依法承担赔偿责任。
四、建议与注意事项
及时鉴定：
- 农户在发现种子可能存在质量问题时，应及时向专业机构或种子管理机构申请鉴定，以便尽快明确责任并采取措施。
保存证据：
- 在申请鉴定和后续处理过程中，农户应妥善保存购买种子的凭证、种子的检验报告、损失评估报告等相关证据。
寻求法律援助：
- 若在处理种子质量问题过程中遇到法律难题或需要维权，农户可以寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到有效保护。
总结：种子质量的鉴定是确保农业生产安全、维护农户权益的重要环节。农户在怀疑种子存在质量问题时，应及时向专业机构或种子管理机构申请鉴定，并妥善保存相关证据。如有需要，可以随时向我咨询相关法律问题。