关于种子有问题申请鉴定费用的承担问题，这通常取决于种子问题的责任归属以及相关法律法规或合同中的约定。以下是从不同角度进行的分析：

1. 如果种子问题由卖方责任导致：

   • 在这种情况下，由于种子存在质量问题，且该问题是由卖方造成的，因此申请鉴定的费用理应由卖方承担。这是基于公平原则和责任归属的考虑，卖方应当为其提供的不合格产品承担相应的责任。

2. 如果种子问题由买方责任导致（如储存不当等）：

   • 若种子问题并非由种子本身的质量问题引起，而是由于买方在储存、使用等过程中存在过错，那么申请鉴定的费用可能需要由买方自行承担。因为此时买方是导致种子问题的直接原因，应当承担相应的费用。

3. 合同中有明确约定的情况：

   • 如果买卖双方在合同中已经明确约定了种子质量问题的鉴定费用承担方式，那么应当遵循合同中的约定。合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力，因此双方应当按照合同约定来履行各自的义务。

4. 法律法规有特别规定的情况：

   • 在某些特定情况下，法律法规可能对种子质量问题的鉴定费用承担有特别规定。例如，某些地区可能出台了相关的地方性法规或规章，对种子质量纠纷的鉴定费用承担进行了明确规定。在这种情况下，应当遵循相关法律法规的规定。

法律建议：

• 在处理种子质量问题时，建议双方首先查阅合同中的相关条款，了解是否有关于鉴定费用承担的约定。
• 如果合同中没有明确约定，或者约定不明确，双方可以协商解决。在协商过程中，可以参考相关法律法规的规定以及行业惯例。
• 如果协商无果，双方可以考虑通过法律途径解决纠纷。在提起诉讼或申请仲裁前，建议咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果鉴定费用承担问题无法得到妥善解决，可能会导致双方之间的纠纷进一步升级，甚至引发诉讼或仲裁等法律程序。
• 在法律程序中，如果一方无法提供充分的证据证明自己的主张，可能会承担不利的法律后果。因此，在处理种子质量问题时，建议双方保留好相关证据，以便在需要时提供证明。

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