企业因虚列成本被立案，将面临税务机关的严厉处罚，包括追缴税款、加收滞纳金以及罚款，情节严重的还可能构成犯罪，需承担刑事责任。以下是对此问题的详细分析：
一、税务行政处罚
追缴税款：
- 根据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁账簿、记账凭证，或者在账簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，税务机关将追缴其不缴或者少缴的税款。
加收滞纳金：
- 税务机关在追缴税款的同时，还会依法加收滞纳金。滞纳金是对纳税人未按时缴纳税款的一种经济制裁，旨在督促纳税人及时履行纳税义务。
罚款：
- 对于偷税行为，税务机关将处以不缴或者少缴的税款百分之五十以上五倍以下的罚款。罚款的幅度根据偷税的情节严重程度而定，情节越严重，罚款比例越高。
二、刑事责任
- 如果企业的虚列成本行为构成犯罪，如逃税罪，那么相关责任人员还将面临刑事责任的追究。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，逃税数额较大并且占应纳税额百分之十以上的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大并且占应纳税额百分之三十以上的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
三、具体案例与启示
- 以咸宁市某二手车交易服务企业为例，该企业因虚列成本、隐匿收入被税务机关查处。经查明，该企业少缴增值税、企业所得税等税费260.34万元。税务机关依法作出处理决定：追缴少缴税费款260.34万元；依法加收滞纳金；对偷税行为处以偷税额50%的罚款129.98万元。此案例警示我们，企业应严格遵守税法规定，如实记账、依法申报，切莫为短期利益铤而走险。
四、法律建议
健全财务制度：
- 企业应建立健全的财务制度，确保账目清晰、准确。避免出现虚列成本、隐匿收入等违法行为。
加强税务合规：
- 企业应加强对税务法规的学习和了解，确保纳税申报的准确性和及时性。避免因对税法理解不足而导致的偷税行为。
积极配合税务机关调查：
- 如果企业被税务机关立案调查，应积极配合调查工作，如实提供相关资料和信息。避免因拒不配合而导致的更严厉的处罚。
企业因虚列成本被立案将面临严重的法律后果。因此，我建议企业务必严格遵守税法规定，加强税务合规管理，确保企业的合法经营和稳健发展。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。