公司不可以直接以考核不合格为由辞退员工，需视具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：

一、合法考核制度下的辞退流程

若用人单位在劳动合同或规章制度中明确约定，考核不通过属于不能胜任工作，且该约定合理合法、经过民主程序制定并已向员工公示，那么当员工考核不过时，可认定其不能胜任工作。但即便如此，用人单位也不能直接辞退。依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应先对员工进行培训或者调整工作岗位。若员工经培训或调岗后，再次考核仍不通过，此时用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。

二、非法考核制度下的辞退后果

如果用人单位没有在合同或制度中明确考核不通过与不能胜任工作的关联，或者没有相应的民主公示程序，直接以考核不过辞退员工，这种行为可能被认定为违法解除劳动合同。员工有权要求用人单位继续履行劳动合同，或者要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金。赔偿金标准通常为经济补偿标准的二倍，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

三、建议与注意事项

1. 完善考核制度：用人单位应制定合法、合理、可量化的考核标准，并确保该标准经过民主程序制定，向员工公示或告知。
2. 遵循法定程序：在辞退员工前，用人单位应确保已履行培训或调岗等法定程序，避免违法解除劳动合同的风险。
3. 保留证据：用人单位在辞退员工时，应保留相关证据，如考核记录、培训记录、调岗通知等，以备不时之需。
4. 员工权益保护：员工在面临辞退时，应了解自己的权益，如要求用人单位继续履行劳动合同或支付赔偿金等。

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