您好，针对您提出的“有船长证驾驶三无船舶怎么处罚”的问题，我可以根据相关法律法规为您做出详细解答。
首先，需要明确的是，“三无船舶”通常指的是无船名船号、无船舶证书、无船籍港的船舶。根据《中华人民共和国海上交通安全法》的相关规定，如果船舶、海上设施未持有有效的证书、文书，包括但不限于船舶国籍证书、船舶检验证书等，那么对船长和有关责任人员将会受到相应的处罚。
具体来说，对于有船长证但驾驶三无船舶的情况，船长和有关责任人员可能会面临以下处罚：
罚款：根据违法情节的轻重，船长和有关责任人员可能会被处以三千元以上三万元以下的罚款。
暂扣或吊销船员适任证书：如果情节严重，比如多次违法、造成严重后果等，海事管理机构可能会暂扣船长、责任船员的船员适任证书，期限从十八个月至三十个月不等，甚至直至吊销船员适任证书。
此外，我还想提醒您，作为船长，不仅需要持有有效的船长证，还需要确保所驾驶的船舶符合所有安全规定和法律法规要求。驾驶三无船舶不仅可能面临法律处罚，还可能对海上交通安全构成严重威胁，因此请务必遵守相关法律法规，确保海上航行的安全。
如果您还有其他关于海上交通安全或船员管理方面的问题，欢迎随时向我提问，我会尽力为您提供清晰、详细、有深度的解答。