在合同主体及权利义务转让的情况下，确定被告应依据具体转让情形和法律规定来判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、合同主体转让（合同承受）
全部转让：
- 当合同一方将合同的权利和义务全部转让给第三人时，若发生纠纷，受让人（即新的合同主体）应作为被告。因为此时原合同关系已经终止，新的合同关系在受让人和另一方当事人之间建立。
- 法律依据：虽然具体的民事诉讼法律条文可能未直接规定此情形下的被告确定，但根据合同转让的原理和民事诉讼中“谁主张，谁举证”以及“与案件有直接利害关系”的原则，受让人作为新的合同主体，自然成为相关纠纷的被告。
部分转让：
- 若合同一方仅将合同的权利或义务部分转让给第三人，此时原合同关系并未完全终止，而是部分权利义务发生了转移。若纠纷涉及转让的部分，受让人和转让人可能作为共同被告，具体取决于纠纷的性质和诉讼请求。
- 法律依据：同样基于合同转让的原理和民事诉讼的相关原则，部分转让时，受让人和转让人都可能与案件有直接利害关系，因此可能作为共同被告。
二、合同权利义务的概括承受（企业合并或分立）
企业合并：
- 当企业发生合并时，原企业的合同权利义务由合并后的企业承继。若因此发生纠纷，合并后的企业应作为被告。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》及相关企业合并的规定，合并后的企业应承继原企业的债权债务，因此成为相关纠纷的被告。
企业分立：
- 当企业发生分立时，原企业的合同权利义务可能由分立后的企业按照分立协议的约定承继。若纠纷涉及分立后的企业，分立后的企业应作为被告。若分立协议对权利义务承继有明确约定，且纠纷与该约定直接相关，则按照约定确定被告；若无约定或约定不明确，可能需要根据实际情况和法律规定判断。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》及相关企业分立的规定，分立后的企业应按照分立协议的约定承继原企业的债权债务。若未约定或约定不明，则根据法律规定和实际情况判断被告。
三、特殊情形下的被告确定
债权转让未通知债务人：
- 若债权转让未通知债务人，债务人仍向原债权人履行债务的，原债权人可能作为被告（若债务人起诉要求确认履行效力或返还财产等）。但若债务人已实际履行且无异议，则可能不涉及被告确定问题。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》关于债权转让的规定，债权转让未通知债务人的，该转让对债务人不发生效力。
债务承担未取得债权人同意：
- 若债务承担未经债权人同意，债权人可能仍向原债务人主张权利，原债务人可能作为被告。但若债务人已实际将债务转移给第三人且第三人已履行部分债务，则可能涉及复杂的三方关系，需要根据具体情况判断被告。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》关于债务承担的规定，债务人将债务的全部或部分转移给第三人的，应当经债权人同意。
法律建议
- 在合同主体及权利义务转让过程中，建议各方当事人明确转让的内容、范围、方式以及纠纷解决机制，并在合同中或通过补充协议进行明确约定。
- 若发生纠纷，建议及时咨询专业律师，根据具体情况和法律规定确定被告，并准备充分的证据材料以支持自己的主张。
有问题可以直接向我咨询，我会结合具体的案情和法律规定，为你提供全面、准确的法律建议。