结论：航天科技2025年第三次临时股东大会审议关联交易议案的程序是否合法，需结合《公司法》及相关法规对股东大会召集、表决程序的规定，以及关联交易的具体审议流程进行综合判断。从新闻背景看，会议通知已明确议案内容，但程序合法性需进一步核查召集程序、表决回避等关键环节。以下从法律角度展开分析：

一、股东大会召集程序的合法性审查

根据《公司法》第110条，临时股东大会应由董事会、监事会或符合条件的股东（单独或合计持股10%以上）召集。新闻背景中未提及召集主体，需确认：

1. 召集主体资格：若由董事会召集，需核查董事会决议是否合法形成；若由股东召集，需确认其持股比例及召集程序是否符合《公司法》第110条第2款规定（如提前15日通知、说明议题等）。
2. 通知内容与形式：根据《公司法》第117条，股东大会通知应载明会议时间、地点、议案内容。新闻背景显示，航天科技已通过公告明确议案（关联交易、选举董事），形式上符合要求，但需核实通知是否提前15日发出，且是否通过法定渠道（如公司官网、证券交易所指定平台）公告。

风险点：若召集主体不适格或通知未满足法定要求，可能导致股东大会决议被撤销（《公司法》第22条）。

二、关联交易议案的审议程序合法性

关联交易需遵循《公司法》第21条（禁止利益输送）及《上市公司治理准则》第74条（关联交易表决回避）等规定，核心审查点包括：

1. 关联方披露：根据《证券法》第80条，上市公司需在定期报告中披露关联方及关联交易。审议前，公司应通过公告明确关联方范围（如控股子公司、实际控制人等）及交易内容（如无形资产转让价格、定价依据等）。新闻背景未提及具体交易细节，需核查公告是否完整披露。
2. 表决回避程序：根据《上市公司治理准则》第74条，关联股东或董事在表决关联交易时需回避。若航天科技控股股东或关联董事参与表决，且未回避，则决议可能因程序违法被撤销。

示例：假设关联交易议案涉及控股子公司向关联方转让无形资产，若控股股东未回避表决，且决议通过比例未扣除其持股数，则程序违法。

三、表决程序的合法性审查

根据《公司法》第111条，股东大会决议需经出席会议股东所持表决权过半数通过（普通决议），但关联交易可能涉及特别决议（如修改公司章程需三分之二以上通过）。需核查：

1. 表决权计算：扣除关联股东表决权后，剩余股东所持表决权是否过半数通过。新闻背景未提及表决结果，需结合最终公告确认。
2. 网络投票合法性：新闻背景提到股东可通过东方财富APP参与网络投票。根据《上市公司股东大会网络投票管理办法》，网络投票需通过证券交易所交易系统或互联网投票平台进行，且需确保投票结果真实、完整。需核查投票系统是否合规、数据是否可追溯。

风险点：若网络投票系统存在漏洞（如数据篡改），或关联股东未回避导致表决权计算错误，可能影响决议效力。

四、对航天科技的合规建议

1. 会前核查：在股东大会召开前，公司应委托律师对召集程序、关联方披露、表决回避等事项进行合规审查，并出具法律意见书。
2. 会中记录：详细记录会议召集、表决过程，尤其是关联股东回避情况，确保决议可追溯。
3. 会后公告：及时公告决议结果，包括表决权统计、关联股东回避情况等，避免信息披露不完整引发的法律风险。

五、延伸思考：关联交易的法律风险与防范

关联交易是上市公司治理的高发风险领域，常见问题包括：

1. 利益输送：通过关联交易低价转让资产、高价采购服务等，损害中小股东利益。
2. 程序违法：未履行关联方披露、表决回避等程序，导致决议被撤销。
3. 信息披露违规：未在定期报告或临时公告中完整披露关联交易，违反《证券法》第80条。

防范措施：

• 建立关联交易管理制度，明确审批流程、定价机制；
• 强化独立董事监督作用，要求独立董事对关联交易发表独立意见；
• 定期开展合规培训，提升董事、高管对关联交易规则的认知。

总结：航天科技2025年第三次临时股东大会审议关联交易议案的程序合法性，需结合召集程序、关联交易披露、表决回避等环节综合判断。建议公司会前进行合规审查，会中规范记录，会后完整披露，以降低法律风险。如有具体问题，可进一步提供细节，我将为您深入分析。