针对您提出的“法院责令被告提交的证据未提交怎么处理”这一问题，我们需要根据具体的法律程序来进行分析。

首先，要明确的是，不同法律程序中未提交证据的情况和处理方式是有所不同的。这主要取决于诉讼的类型，如民事诉讼、刑事诉讼还是行政诉讼。

一、民事诉讼中的处理

在民事诉讼中，根据《民事诉讼法》的相关规定，当事人对自己提出的主张有责任提供证据。如果法院责令被告提交某项证据，而被告逾期未提交，那么这可能被视为被告放弃了举证权利。但这里也存在例外情况，比如如果被告因客观原因（如不可抗力、证据在第三方手中且无法及时获取等）逾期提供证据，并在人民法院责令说明理由后，理由成立的，那么该证据仍然可能被法院采纳。

二、刑事诉讼中的处理

在刑事诉讼中，举证责任主要由公诉机关承担。被告人及其辩护人一般无需主动提交证据，但他们有自行收集证据的权利。如果因疏忽未提交相关证据线索，被告人或其辩护人可以在法律允许的范围内补充提交，并向法庭说明情况，争取被法庭考虑。不过，需要注意的是，如果公诉机关未提交足够证据证明被告人有罪，那么可能导致指控不成立，犯罪嫌疑人被宣告无罪。

三、行政诉讼中的处理

在行政诉讼中，当事人同样需要对自己的主张提供证据。如果法院责令被告提交某项证据，而被告未提交，那么被告可能承担不利后果。但同样，如果被告有合理理由逾期提交证据，并且经法院审查认可，那么该证据也可能被采纳。

四、未提交证据的法律后果与责任

无论在哪种诉讼中，未提交证据都可能对当事人的诉讼主张产生严重影响。如果负有举证责任的一方未提交关键证据，那么法院可能对其主张不予采信。此外，如果故意隐匿、伪造证据，还可能构成妨碍诉讼的违法行为，面临罚款、拘留等处罚，情节严重的甚至可能构成犯罪，要承担刑事责任。

五、建议与应对

1. 及时沟通：如果因客观原因无法及时提交证据，应及时与法院沟通，说明情况，并申请延期举证。
2. 补充证据：如果发现遗漏了重要证据，应在法律允许的范围内尽快补充提交，并向法庭说明情况。
3. 咨询专业律师：对于复杂的法律问题，建议咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。

综上所述，法院责令被告提交的证据未提交时，处理方式取决于具体的法律程序和未提交证据的原因。因此，在处理此类问题时，务必根据具体情况进行妥善应对。