重大事故隐患不一定要行政处罚，但多数情况下会面临行政处罚，特定情形下可能免罚或入刑。以下从不同角度进行分析：

行政处罚的常规情形

根据《安全生产事故隐患排查治理暂行规定》及《中华人民共和国安全生产法》的相关规定，生产经营单位若未履行事故隐患排查治理职责，特别是存在重大事故隐患且未及时报告或未采取措施消除的，将依法受到行政处罚。这些处罚措施包括但不限于警告、罚款、责令停产停业整顿等。例如，若生产经营单位未建立安全生产事故隐患排查治理制度，或未按规定上报事故隐患排查治理情况，或未对事故隐患进行排查治理而擅自生产经营的，都可能面临三万元以下的罚款。

特定情形下的免罚

值得注意的是，某些地区或行业可能出台了针对企业自查自改重大事故隐患的免罚制度。以上饶市为例，该市出台了《上饶市企业重大事故隐患自查免罚制度》，旨在激发企业自查自改重大事故隐患的内生动力，给予企业合法合规的容错空间。在这一制度下，若企业能够主动自查并报告重大事故隐患，且在一定期限内完成整改，可能免予行政处罚。

刑事责任的追究

除了行政处罚外，若重大事故隐患导致发生重大伤亡事故或造成其他严重后果，相关责任人员还可能面临刑事责任的追究。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，如重大责任事故罪、强令违章冒险作业罪以及危险作业罪等，都可能对责任人员处以有期徒刑、拘役或管制等刑罚。

实务中的复杂情形

在实务中，对于生产经营单位存在未采取措施消除两项以上（重大）事故隐患的情况，是按照一个违法行为处罚还是按照两个以上违法行为处罚，可能存在争议。这需要根据案件事实具体问题具体分析，包括违法事实的不同、违反的国家标准或行业标准的不同等因素。

建议：

• 生产经营单位应建立健全并落实生产安全事故隐患排查治理制度，采取技术、管理措施，及时发现并消除事故隐患。
• 对于重大事故隐患，应及时向负有安全生产监督管理职责的部门和职工大会或职工代表大会报告。
• 若企业所在地区或行业有自查自改重大事故隐患的免罚制度，应积极了解并利用这一政策，主动自查自改，以降低法律风险。

如有任何关于重大事故隐患处理的具体法律问题，欢迎直接向我咨询。