针对您提出的“盗窃公章再担保借款怎么处理”的问题，这是一个涉及法律层面的复杂情况，需要公司从多个角度进行综合应对。以下是我为您提供的详细解答：

一、紧急应对措施

1. 立即报警： 一旦发现公章被盗取并用于非法担保借款，公司应第一时间向当地公安机关报案。在报案时，需提供详细的情况说明，包括公章被盗的时间、地点、可能的嫌疑人信息，以及任何相关的监控录像等证据。警方将会展开调查，并追踪犯罪嫌疑人。

2. 通知相关方： 公司应迅速通知与担保借款事项相关的金融机构、债权人等第三方，明确告知他们该担保行为是无效的，因为公章是被盗用的。这一步骤至关重要，它有助于防止损失进一步扩大，并避免公司陷入不必要的法律纠纷。

3. 内部自查与整改： 公司应立即对公司内部进行彻底的自查，查明公章管理上的漏洞，并采取有效措施进行整改。这包括加强公章的保管制度，如使用保险柜存放公章，并设置严格的领取和归还流程；同时，加强公章的使用审批制度，确保每一次使用公章都有明确的记录和审批。

二、法律责任分析

1. 民事责任：

   • 担保合同效力：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，盗用人擅自使用公章进行的担保并非公司的真实意思表示，因此该担保合同通常被视为无效。但是，如果盗用人的行为构成了表见代理（即盗用人曾长期代表公司与相对人进行交易，使相对人有合理理由相信其有代理权），那么该担保合同可能被认定为有效。
   • 公司权利主张：公司有权向法院提起诉讼，要求确认担保合同无效，并请求有过错的一方赔偿损失。如果相对人明知或应知盗用情况仍签订合同，公司则无需承担担保责任，并可以要求返还因无效合同取得的财产。
   • 向盗用人追偿：公司因盗用人的行为遭受的损失（如费用支出、名誉损失等），有权通过民事诉讼向其追偿。

2. 刑事责任：

   • 盗窃罪：盗用人以非法占有为目的，秘密窃取公章，可能构成盗窃罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，盗窃公私财物，数额较大的，或者存在多次盗窃、入户盗窃等情形的，将面临刑事处罚。
   • 合同诈骗罪：如果盗用人利用盗取的公章签订担保合同，骗取对方当事人财物，且数额较大，那么其可能构成合同诈骗罪，并将受到相应的刑事处罚。

三、行政层面的处理

1. 公章挂失与重新刻制： 公司应立即向公安机关报案并办理公章挂失手续。随后，按照相关规定重新刻制公章，以确保公司印章的正常使用和管理安全。

2. 加强内部管理： 公司应反思并完善公章管理制度，加强对公章的保管、使用审批等环节的管理。建立严格的公章使用登记制度，明确使用流程和审批权限。同时，提高员工的法律意识和职业素养，通过培训和教育等方式预防类似事件的再次发生。

综上所述，面对盗窃公章再担保借款的情况，公司应迅速采取紧急措施保护自身权益，并从民事、刑事和行政三个层面进行综合应对。通过法律途径追究盗用人的责任，加强内部管理，确保公司的合法权益得到有效维护，并预防类似事件的再次发生。