工程诉讼时效并非都从质保期满起算，而是需要依据具体情况来确定起算点。以下是对此问题的详细分析：
一、工程款支付纠纷的诉讼时效起算
有约定付款期限的情况：
- 如果建设工程施工合同中明确约定了工程款的付款期限，那么诉讼时效通常从该约定的付款期限届满之日起算。例如，合同约定工程完工后30日内支付工程款，若发包人未按时支付，则承包人应在付款期限届满之日起3年内提起诉讼。
无约定付款期限的情况：
- 如果合同未约定工程款的付款期限，那么诉讼时效通常从工程交付或提交竣工结算文件之日起算。这是因为，在工程交付或提交竣工结算文件后，承包人应已完成了其合同义务，发包人应按时支付工程款。若发包人未支付，则承包人应在此时起算诉讼时效。
二、质保金返还纠纷的诉讼时效起算
有约定返还期限的情况：
- 如果合同中明确约定了质保金的返还期限，那么诉讼时效通常从该约定的返还期限届满之日起算。例如，合同约定质保期为2年，质保期满后30日内返还质保金，若发包人未按时返还，则承包人应在返还期限届满之日起3年内提起诉讼。
无约定返还期限的情况：
- 如果合同未约定质保金的返还期限，那么根据相关规定，诉讼时效通常自工程竣工验收满两年起算。但需注意，这一规定可能因具体法律法规或地方性法规的调整而有所变化，因此在实际操作中应结合具体情况进行判断。
三、质保期内出现质量问题的诉讼时效起算
- 如果在质保期内工程出现质量问题，并且施工方进行了维修但维修后仍存在质量问题或又出现新的质量问题，那么诉讼时效通常从新的质量问题确定且施工方拒绝承担责任之日起计算。这是因为，在此时点，承包人才明确知道其权利受到了损害，并且可以确定义务人（即施工方）拒绝履行其保修义务。
四、实际损害发生时的诉讼时效起算
- 如果工程质量问题导致了实际损害（如房屋漏水导致家具损坏），并且该损害结果能够确定是由工程质量问题导致的，那么诉讼时效可能从损害结果发生之日起计算。但需注意，这一规定可能因具体案件情况和相关法律法规的调整而有所变化。
五、建议与注意事项
- 及时维权：一旦发现工程质量问题或工程款支付问题，应及时与对方沟通并要求解决，以避免超过诉讼时效期间。
- 保留证据：妥善保留所有与工程质量问题或工程款支付问题相关的证据，包括合同文本、维修记录、照片、视频等，以便在诉讼中支持自己的主张。
- 咨询专业律师：虽然我作为专业律师已经给出了详细的解答，但在处理具体案件时，仍建议根据案件的具体情况咨询我，以确保自身权益得到有效维护。
综上所述，工程诉讼时效的起算并非简单地从质保期满开始，而是需要依据合同约定、实际损害发生情况以及相关法律法规的特殊规定来确定。因此，在处理此类纠纷时，应充分了解相关法律规定，并采取相应的法律措施以确保自身合法权益不受侵害。