祖父与母亲不能直接确定儿子的亲子关系。亲子关系的确认或否认，在法律上有着明确的规定和程序，以下从几个方面进行详细分析：
法律主体资格：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十三条，对亲子关系有异议且有正当理由的，父或者母可以向人民法院提起诉讼，请求确认或者否认亲子关系。这里明确指出了有权提起诉讼的主体是父亲或母亲，并不包括祖父。
- 祖父作为家族中的长辈，虽然对家族事务有着深厚的情感和关注，但在法律上，他并不具备直接确认或否认亲子关系的主体资格。
亲子关系确认的程序：
- 亲子关系的确认通常需要通过科学鉴定，如DNA鉴定等，来提供客观、准确的证据。
- 在法律程序中，如果父亲或母亲对亲子关系有异议，他们可以向法院提起诉讼，并申请进行亲子鉴定。法院会根据鉴定结果和其他证据，作出公正的裁判。
- 祖父无法直接启动这一法律程序，因为他不是法律规定的主体。
祖父的可能角色：
- 虽然祖父不能直接确认或否认亲子关系，但他在家庭中可能扮演着重要的角色，如提供情感支持、协助处理家庭事务等。
- 如果祖父对亲子关系有疑虑或关注，他可以与父亲或母亲进行沟通，鼓励他们通过法律途径来解决疑问。
法律建议：
- 如果您或您的家人对亲子关系有异议，建议首先与直接相关的父亲或母亲进行沟通。
- 如果沟通无果，或者需要法律上的确认或否认，父亲或母亲可以向人民法院提起诉讼，并申请进行亲子鉴定。
- 在整个过程中，保持冷静和理性，尊重法律程序和科学鉴定结果。
总结：祖父与母亲不能直接确定儿子的亲子关系。亲子关系的确认或否认需要遵循法律程序，由父亲或母亲作为主体向法院提起诉讼，并申请进行亲子鉴定。如果您或您的家人面临此类问题，建议寻求法律上的帮助和指导，以确保权益得到充分保护。如果有任何法律问题，都可以直接向我咨询。