如果您的摩托车被偷了3年后又找到了，您可以按照以下步骤处理：

1. 立即报警：

   • 找到摩托车后，第一时间向当地警方报案，让警方将案件记录在案并着手处理。
   • 妥善安置找到的摩托车，防止其再次丢失或受损。

2. 配合警方调查：

   • 在警方处理案件期间，全力配合警方的工作，提供摩托车的相关信息，如购买凭证、行驶证等，以证明车辆的合法所有权。
   • 如实向警方陈述摩托车被盗和找回的经过，以便警方能够更准确地调查案件。

3. 维护合法权益：

   • 如果摩托车在被盗期间被损坏，您可以要求小偷或相关责任人承担维修费用，并赔偿丢失的配件。
   • 等待警方调查完毕并确定车辆归属后，根据实际情况，摩托车可能会被归还给您，或者进行相关的司法处理。

4. 后续关注：

   • 关注案件的进展，及时了解警方的调查结果和后续处理情况。
   • 如有需要，可以咨询专业律师，了解相关的法律程序和权益保护方法。

综上所述，找到被盗的摩托车后，应立即报警并配合警方调查，同时维护自己的合法权益。在整个过程中，保持与警方的沟通，并关注案件的进展。如有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。