将小产权房通过起诉调解归属并不合法。以下是详细分析：

1. 小产权房的性质：

   • 小产权房通常指的是在未经国家正规土地和规划审批的情况下，由开发商或个人在集体土地上建设的房屋。这类房屋没有国家颁发的正规房产证，因此其产权并不受法律保护。

2. 起诉调解的适用范围：

   • 起诉调解通常用于解决具有明确法律关系和权利义务的纠纷，如合同纠纷、侵权纠纷等。然而，小产权房的产权问题涉及土地使用权、规划审批等多个复杂环节，且往往存在违法违规情况。

3. 法律后果：

   • 即使通过起诉调解达成了关于小产权房归属的协议，但由于小产权房本身不具备合法产权，因此该协议在法律上可能被视为无效。一旦发生纠纷，法院可能不会支持基于该协议提出的权利主张。
   • 此外，购买、出售或调解小产权房还可能面临行政处罚、拆除等法律风险。

4. 建议：

   • 对于小产权房的归属问题，建议通过合法途径解决，如咨询当地政府部门、寻求专业法律意见等。
   • 如果已经涉及小产权房的纠纷，应尽快咨询专业律师，了解相关法律规定和可能面临的法律风险，以便采取合适的应对措施。

综上所述，将小产权房通过起诉调解归属并不合法，且可能面临诸多法律风险。因此，在处理小产权房相关问题时，应谨慎行事，遵守相关法律法规。